Protein–RNA interactions for Protein: P54761

Ephb4, Ephrin type-B receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb4P54761 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ephb4P54761 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ephb4P54761 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ephb4P54761 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ephb4P54761 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ephb4P54761 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ephb4P54761 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ephb4P54761 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ephb4P54761 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ephb4P54761 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ephb4P54761 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ephb4P54761 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ephb4P54761 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ephb4P54761 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ephb4P54761 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ephb4P54761 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Ephb4P54761 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ephb4P54761 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ephb4P54761 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ephb4P54761 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ephb4P54761 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ephb4P54761 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ephb4P54761 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ephb4P54761 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ephb4P54761 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ephb4P54761 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ephb4P54761 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ephb4P54761 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ephb4P54761 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ephb4P54761 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ephb4P54761 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ephb4P54761 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ephb4P54761 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ephb4P54761 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ephb4P54761 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ephb4P54761 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ephb4P54761 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ephb4P54761 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ephb4P54761 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ephb4P54761 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ephb4P54761 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ephb4P54761 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ephb4P54761 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ephb4P54761 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ephb4P54761 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ephb4P54761 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Ephb4P54761 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ephb4P54761 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ephb4P54761 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ephb4P54761 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ephb4P54761 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ephb4P54761 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ephb4P54761 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ephb4P54761 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ephb4P54761 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ephb4P54761 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ephb4P54761 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ephb4P54761 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ephb4P54761 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ephb4P54761 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ephb4P54761 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ephb4P54761 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ephb4P54761 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ephb4P54761 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ephb4P54761 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ephb4P54761 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ephb4P54761 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Ephb4P54761 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ephb4P54761 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ephb4P54761 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ephb4P54761 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ephb4P54761 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ephb4P54761 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ephb4P54761 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ephb4P54761 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ephb4P54761 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ephb4P54761 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ephb4P54761 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ephb4P54761 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ephb4P54761 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ephb4P54761 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ephb4P54761 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ephb4P54761 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ephb4P54761 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ephb4P54761 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ephb4P54761 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ephb4P54761 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ephb4P54761 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ephb4P54761 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ephb4P54761 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ephb4P54761 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ephb4P54761 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ephb4P54761 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ephb4P54761 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ephb4P54761 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ephb4P54761 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Ephb4P54761 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ephb4P54761 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ephb4P54761 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ephb4P54761 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms