Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rad23aP54726 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rad23aP54726 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rad23aP54726 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rad23aP54726 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rad23aP54726 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Rad23aP54726 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rad23aP54726 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rad23aP54726 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rad23aP54726 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rad23aP54726 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rad23aP54726 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rad23aP54726 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rad23aP54726 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rad23aP54726 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rad23aP54726 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Rad23aP54726 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rad23aP54726 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rad23aP54726 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Rad23aP54726 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rad23aP54726 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rad23aP54726 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rad23aP54726 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rad23aP54726 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rad23aP54726 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rad23aP54726 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rad23aP54726 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rad23aP54726 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rad23aP54726 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Rad23aP54726 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rad23aP54726 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rad23aP54726 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rad23aP54726 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rad23aP54726 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rad23aP54726 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rad23aP54726 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rad23aP54726 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rad23aP54726 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rad23aP54726 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rad23aP54726 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rad23aP54726 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rad23aP54726 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rad23aP54726 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Rad23aP54726 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rad23aP54726 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rad23aP54726 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rad23aP54726 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rad23aP54726 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rad23aP54726 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rad23aP54726 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rad23aP54726 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rad23aP54726 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rad23aP54726 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rad23aP54726 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rad23aP54726 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rad23aP54726 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rad23aP54726 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rad23aP54726 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Rad23aP54726 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rad23aP54726 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rad23aP54726 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Rad23aP54726 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rad23aP54726 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rad23aP54726 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rad23aP54726 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Rad23aP54726 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rad23aP54726 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rad23aP54726 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rad23aP54726 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rad23aP54726 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rad23aP54726 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rad23aP54726 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Rad23aP54726 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rad23aP54726 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Rad23aP54726 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rad23aP54726 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rad23aP54726 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rad23aP54726 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rad23aP54726 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rad23aP54726 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rad23aP54726 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rad23aP54726 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rad23aP54726 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rad23aP54726 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rad23aP54726 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rad23aP54726 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rad23aP54726 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rad23aP54726 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rad23aP54726 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rad23aP54726 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rad23aP54726 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rad23aP54726 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rad23aP54726 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rad23aP54726 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rad23aP54726 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rad23aP54726 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rad23aP54726 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rad23aP54726 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rad23aP54726 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rad23aP54726 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms