Protein–RNA interactions for Protein: P54254

Atxn1, Ataxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn1P54254 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atxn1P54254 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atxn1P54254 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atxn1P54254 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atxn1P54254 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Atxn1P54254 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Atxn1P54254 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atxn1P54254 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atxn1P54254 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Atxn1P54254 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atxn1P54254 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atxn1P54254 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Atxn1P54254 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atxn1P54254 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atxn1P54254 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Atxn1P54254 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Atxn1P54254 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Atxn1P54254 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atxn1P54254 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atxn1P54254 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atxn1P54254 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atxn1P54254 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atxn1P54254 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atxn1P54254 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Atxn1P54254 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atxn1P54254 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atxn1P54254 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atxn1P54254 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atxn1P54254 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atxn1P54254 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atxn1P54254 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atxn1P54254 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atxn1P54254 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atxn1P54254 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atxn1P54254 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atxn1P54254 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atxn1P54254 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atxn1P54254 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atxn1P54254 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Atxn1P54254 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atxn1P54254 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atxn1P54254 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atxn1P54254 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atxn1P54254 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atxn1P54254 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atxn1P54254 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atxn1P54254 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atxn1P54254 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atxn1P54254 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atxn1P54254 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atxn1P54254 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atxn1P54254 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atxn1P54254 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atxn1P54254 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atxn1P54254 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atxn1P54254 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atxn1P54254 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atxn1P54254 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atxn1P54254 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atxn1P54254 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atxn1P54254 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atxn1P54254 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atxn1P54254 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atxn1P54254 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atxn1P54254 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atxn1P54254 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atxn1P54254 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atxn1P54254 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atxn1P54254 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atxn1P54254 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atxn1P54254 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atxn1P54254 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atxn1P54254 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atxn1P54254 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Atxn1P54254 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atxn1P54254 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atxn1P54254 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Atxn1P54254 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Atxn1P54254 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atxn1P54254 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atxn1P54254 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atxn1P54254 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atxn1P54254 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atxn1P54254 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atxn1P54254 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Atxn1P54254 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atxn1P54254 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atxn1P54254 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atxn1P54254 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atxn1P54254 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atxn1P54254 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atxn1P54254 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atxn1P54254 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atxn1P54254 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atxn1P54254 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atxn1P54254 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Atxn1P54254 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atxn1P54254 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atxn1P54254 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atxn1P54254 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms