Protein–RNA interactions for Protein: P53994

Rab2a, Ras-related protein Rab-2A, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab2aP53994 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab2aP53994 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab2aP53994 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab2aP53994 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab2aP53994 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab2aP53994 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab2aP53994 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab2aP53994 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab2aP53994 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab2aP53994 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab2aP53994 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab2aP53994 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab2aP53994 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab2aP53994 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab2aP53994 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rab2aP53994 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rab2aP53994 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rab2aP53994 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rab2aP53994 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rab2aP53994 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rab2aP53994 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rab2aP53994 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rab2aP53994 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rab2aP53994 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rab2aP53994 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab2aP53994 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab2aP53994 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab2aP53994 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab2aP53994 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab2aP53994 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab2aP53994 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab2aP53994 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab2aP53994 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab2aP53994 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab2aP53994 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab2aP53994 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab2aP53994 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab2aP53994 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab2aP53994 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab2aP53994 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab2aP53994 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab2aP53994 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab2aP53994 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab2aP53994 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab2aP53994 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab2aP53994 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab2aP53994 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab2aP53994 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab2aP53994 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab2aP53994 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab2aP53994 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab2aP53994 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab2aP53994 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab2aP53994 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab2aP53994 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab2aP53994 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab2aP53994 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab2aP53994 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab2aP53994 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab2aP53994 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab2aP53994 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rab2aP53994 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab2aP53994 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab2aP53994 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab2aP53994 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab2aP53994 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab2aP53994 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab2aP53994 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab2aP53994 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab2aP53994 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab2aP53994 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab2aP53994 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab2aP53994 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab2aP53994 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab2aP53994 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab2aP53994 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab2aP53994 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab2aP53994 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab2aP53994 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab2aP53994 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab2aP53994 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rab2aP53994 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab2aP53994 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab2aP53994 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rab2aP53994 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab2aP53994 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab2aP53994 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab2aP53994 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab2aP53994 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab2aP53994 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab2aP53994 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab2aP53994 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab2aP53994 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab2aP53994 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab2aP53994 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab2aP53994 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab2aP53994 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab2aP53994 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab2aP53994 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab2aP53994 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms