Protein–RNA interactions for Protein: P53702

Hccs, Cytochrome c-type heme lyase, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HccsP53702 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HccsP53702 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HccsP53702 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HccsP53702 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HccsP53702 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HccsP53702 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HccsP53702 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HccsP53702 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HccsP53702 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HccsP53702 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HccsP53702 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HccsP53702 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HccsP53702 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HccsP53702 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HccsP53702 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HccsP53702 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HccsP53702 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HccsP53702 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HccsP53702 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HccsP53702 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HccsP53702 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HccsP53702 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HccsP53702 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HccsP53702 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HccsP53702 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HccsP53702 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HccsP53702 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HccsP53702 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HccsP53702 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HccsP53702 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HccsP53702 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HccsP53702 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HccsP53702 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HccsP53702 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HccsP53702 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HccsP53702 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HccsP53702 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HccsP53702 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HccsP53702 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HccsP53702 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HccsP53702 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HccsP53702 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HccsP53702 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HccsP53702 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HccsP53702 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HccsP53702 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
HccsP53702 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HccsP53702 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HccsP53702 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HccsP53702 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HccsP53702 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HccsP53702 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HccsP53702 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HccsP53702 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HccsP53702 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HccsP53702 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HccsP53702 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HccsP53702 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HccsP53702 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HccsP53702 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HccsP53702 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HccsP53702 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HccsP53702 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HccsP53702 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HccsP53702 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HccsP53702 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HccsP53702 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HccsP53702 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HccsP53702 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HccsP53702 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HccsP53702 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HccsP53702 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HccsP53702 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HccsP53702 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HccsP53702 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HccsP53702 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HccsP53702 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HccsP53702 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HccsP53702 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HccsP53702 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HccsP53702 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HccsP53702 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HccsP53702 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HccsP53702 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HccsP53702 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HccsP53702 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HccsP53702 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HccsP53702 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HccsP53702 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HccsP53702 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HccsP53702 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HccsP53702 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HccsP53702 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HccsP53702 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HccsP53702 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HccsP53702 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HccsP53702 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HccsP53702 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HccsP53702 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HccsP53702 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms