Protein–RNA interactions for Protein: P52482

Ube2e1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e1P52482 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ube2e1P52482 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ube2e1P52482 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ube2e1P52482 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ube2e1P52482 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ube2e1P52482 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ube2e1P52482 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ube2e1P52482 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ube2e1P52482 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ube2e1P52482 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ube2e1P52482 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ube2e1P52482 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube2e1P52482 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube2e1P52482 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube2e1P52482 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ube2e1P52482 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ube2e1P52482 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ube2e1P52482 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ube2e1P52482 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ube2e1P52482 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube2e1P52482 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube2e1P52482 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube2e1P52482 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube2e1P52482 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2e1P52482 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2e1P52482 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2e1P52482 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2e1P52482 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2e1P52482 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube2e1P52482 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube2e1P52482 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube2e1P52482 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube2e1P52482 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube2e1P52482 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2e1P52482 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2e1P52482 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2e1P52482 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube2e1P52482 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube2e1P52482 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube2e1P52482 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube2e1P52482 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ube2e1P52482 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ube2e1P52482 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ube2e1P52482 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ube2e1P52482 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ube2e1P52482 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ube2e1P52482 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ube2e1P52482 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2e1P52482 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2e1P52482 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2e1P52482 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2e1P52482 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2e1P52482 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2e1P52482 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2e1P52482 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2e1P52482 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2e1P52482 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2e1P52482 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2e1P52482 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2e1P52482 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2e1P52482 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2e1P52482 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2e1P52482 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2e1P52482 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2e1P52482 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2e1P52482 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2e1P52482 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2e1P52482 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2e1P52482 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2e1P52482 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2e1P52482 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube2e1P52482 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube2e1P52482 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube2e1P52482 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube2e1P52482 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube2e1P52482 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube2e1P52482 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube2e1P52482 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ube2e1P52482 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2e1P52482 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2e1P52482 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2e1P52482 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2e1P52482 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2e1P52482 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ube2e1P52482 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ube2e1P52482 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ube2e1P52482 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ube2e1P52482 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ube2e1P52482 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ube2e1P52482 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2e1P52482 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2e1P52482 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2e1P52482 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2e1P52482 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2e1P52482 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2e1P52482 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2e1P52482 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2e1P52482 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube2e1P52482 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube2e1P52482 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms