Protein–RNA interactions for Protein: P52479

Usp10, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 10, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp10P52479 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp10P52479 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp10P52479 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp10P52479 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp10P52479 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp10P52479 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp10P52479 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp10P52479 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp10P52479 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp10P52479 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp10P52479 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp10P52479 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp10P52479 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp10P52479 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp10P52479 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp10P52479 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp10P52479 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp10P52479 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp10P52479 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp10P52479 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp10P52479 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp10P52479 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp10P52479 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp10P52479 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp10P52479 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp10P52479 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp10P52479 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp10P52479 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp10P52479 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp10P52479 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp10P52479 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp10P52479 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp10P52479 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp10P52479 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp10P52479 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp10P52479 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Usp10P52479 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Usp10P52479 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp10P52479 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp10P52479 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp10P52479 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp10P52479 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp10P52479 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp10P52479 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp10P52479 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp10P52479 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp10P52479 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp10P52479 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp10P52479 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp10P52479 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp10P52479 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp10P52479 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp10P52479 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp10P52479 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp10P52479 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp10P52479 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp10P52479 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp10P52479 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp10P52479 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp10P52479 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp10P52479 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp10P52479 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp10P52479 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp10P52479 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp10P52479 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp10P52479 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp10P52479 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp10P52479 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Usp10P52479 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Usp10P52479 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp10P52479 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp10P52479 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp10P52479 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp10P52479 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp10P52479 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp10P52479 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp10P52479 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp10P52479 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp10P52479 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp10P52479 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp10P52479 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp10P52479 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp10P52479 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp10P52479 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp10P52479 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp10P52479 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp10P52479 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp10P52479 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp10P52479 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp10P52479 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp10P52479 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp10P52479 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp10P52479 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp10P52479 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp10P52479 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Usp10P52479 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp10P52479 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp10P52479 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp10P52479 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp10P52479 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms