Protein–RNA interactions for Protein: P51612

Xpc, DNA repair protein complementing XP-C cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XpcP51612 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
XpcP51612 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
XpcP51612 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
XpcP51612 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
XpcP51612 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
XpcP51612 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
XpcP51612 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
XpcP51612 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
XpcP51612 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
XpcP51612 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
XpcP51612 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
XpcP51612 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
XpcP51612 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
XpcP51612 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
XpcP51612 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
XpcP51612 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
XpcP51612 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
XpcP51612 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
XpcP51612 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
XpcP51612 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
XpcP51612 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
XpcP51612 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
XpcP51612 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
XpcP51612 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
XpcP51612 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
XpcP51612 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
XpcP51612 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
XpcP51612 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
XpcP51612 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
XpcP51612 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
XpcP51612 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
XpcP51612 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
XpcP51612 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
XpcP51612 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
XpcP51612 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
XpcP51612 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
XpcP51612 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
XpcP51612 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
XpcP51612 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
XpcP51612 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
XpcP51612 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
XpcP51612 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
XpcP51612 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
XpcP51612 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
XpcP51612 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
XpcP51612 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
XpcP51612 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
XpcP51612 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
XpcP51612 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
XpcP51612 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
XpcP51612 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
XpcP51612 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
XpcP51612 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
XpcP51612 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
XpcP51612 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
XpcP51612 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
XpcP51612 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
XpcP51612 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
XpcP51612 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
XpcP51612 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
XpcP51612 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
XpcP51612 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
XpcP51612 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
XpcP51612 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
XpcP51612 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
XpcP51612 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
XpcP51612 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
XpcP51612 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
XpcP51612 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
XpcP51612 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
XpcP51612 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
XpcP51612 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
XpcP51612 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
XpcP51612 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
XpcP51612 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
XpcP51612 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
XpcP51612 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
XpcP51612 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
XpcP51612 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
XpcP51612 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
XpcP51612 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
XpcP51612 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
XpcP51612 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
XpcP51612 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
XpcP51612 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
XpcP51612 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
XpcP51612 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
XpcP51612 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
XpcP51612 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
XpcP51612 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
XpcP51612 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
XpcP51612 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
XpcP51612 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.57■■■□□ 2
XpcP51612 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
XpcP51612 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
XpcP51612 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
XpcP51612 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
XpcP51612 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
XpcP51612 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
XpcP51612 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms