Protein–RNA interactions for Protein: P50707

Defa9, Alpha-defensin 9, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa9P50707 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa9P50707 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa9P50707 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa9P50707 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa9P50707 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa9P50707 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa9P50707 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa9P50707 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa9P50707 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa9P50707 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa9P50707 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa9P50707 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa9P50707 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa9P50707 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa9P50707 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa9P50707 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa9P50707 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa9P50707 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa9P50707 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa9P50707 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa9P50707 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Defa9P50707 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Defa9P50707 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa9P50707 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa9P50707 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa9P50707 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa9P50707 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa9P50707 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa9P50707 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa9P50707 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa9P50707 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa9P50707 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa9P50707 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa9P50707 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa9P50707 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa9P50707 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa9P50707 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa9P50707 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa9P50707 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa9P50707 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa9P50707 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa9P50707 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa9P50707 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa9P50707 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa9P50707 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa9P50707 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa9P50707 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa9P50707 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa9P50707 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa9P50707 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa9P50707 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa9P50707 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa9P50707 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa9P50707 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa9P50707 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa9P50707 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa9P50707 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa9P50707 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa9P50707 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Defa9P50707 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa9P50707 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa9P50707 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa9P50707 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa9P50707 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa9P50707 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa9P50707 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa9P50707 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa9P50707 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa9P50707 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa9P50707 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa9P50707 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa9P50707 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa9P50707 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa9P50707 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa9P50707 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa9P50707 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa9P50707 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa9P50707 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa9P50707 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa9P50707 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa9P50707 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa9P50707 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa9P50707 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa9P50707 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa9P50707 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa9P50707 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa9P50707 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa9P50707 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa9P50707 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa9P50707 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa9P50707 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa9P50707 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa9P50707 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa9P50707 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa9P50707 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa9P50707 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa9P50707 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa9P50707 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa9P50707 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa9P50707 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms