Protein–RNA interactions for Protein: P50652

Fancc, Fanconi anemia group C protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FanccP50652 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FanccP50652 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FanccP50652 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FanccP50652 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
FanccP50652 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FanccP50652 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
FanccP50652 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FanccP50652 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FanccP50652 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FanccP50652 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FanccP50652 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FanccP50652 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FanccP50652 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FanccP50652 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
FanccP50652 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FanccP50652 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FanccP50652 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
FanccP50652 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FanccP50652 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FanccP50652 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FanccP50652 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FanccP50652 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FanccP50652 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FanccP50652 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FanccP50652 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
FanccP50652 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FanccP50652 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FanccP50652 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FanccP50652 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FanccP50652 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
FanccP50652 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FanccP50652 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
FanccP50652 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FanccP50652 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FanccP50652 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FanccP50652 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
FanccP50652 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FanccP50652 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
FanccP50652 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FanccP50652 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
FanccP50652 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FanccP50652 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FanccP50652 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FanccP50652 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FanccP50652 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FanccP50652 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FanccP50652 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FanccP50652 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FanccP50652 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FanccP50652 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FanccP50652 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FanccP50652 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
FanccP50652 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FanccP50652 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FanccP50652 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FanccP50652 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FanccP50652 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FanccP50652 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FanccP50652 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FanccP50652 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FanccP50652 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FanccP50652 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
FanccP50652 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FanccP50652 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FanccP50652 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FanccP50652 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FanccP50652 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FanccP50652 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FanccP50652 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
FanccP50652 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FanccP50652 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FanccP50652 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FanccP50652 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FanccP50652 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FanccP50652 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FanccP50652 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FanccP50652 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FanccP50652 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FanccP50652 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FanccP50652 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FanccP50652 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FanccP50652 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
FanccP50652 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FanccP50652 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FanccP50652 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FanccP50652 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FanccP50652 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FanccP50652 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FanccP50652 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FanccP50652 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FanccP50652 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
FanccP50652 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FanccP50652 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FanccP50652 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FanccP50652 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FanccP50652 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FanccP50652 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FanccP50652 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FanccP50652 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FanccP50652 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
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