Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TspoP50637 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TspoP50637 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TspoP50637 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TspoP50637 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TspoP50637 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TspoP50637 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TspoP50637 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TspoP50637 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TspoP50637 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TspoP50637 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TspoP50637 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TspoP50637 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TspoP50637 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TspoP50637 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TspoP50637 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TspoP50637 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TspoP50637 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TspoP50637 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TspoP50637 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TspoP50637 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TspoP50637 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TspoP50637 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TspoP50637 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TspoP50637 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TspoP50637 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TspoP50637 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TspoP50637 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TspoP50637 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TspoP50637 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TspoP50637 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TspoP50637 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TspoP50637 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TspoP50637 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TspoP50637 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TspoP50637 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TspoP50637 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TspoP50637 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TspoP50637 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TspoP50637 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TspoP50637 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TspoP50637 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TspoP50637 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TspoP50637 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TspoP50637 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TspoP50637 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TspoP50637 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TspoP50637 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TspoP50637 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TspoP50637 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TspoP50637 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TspoP50637 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TspoP50637 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TspoP50637 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TspoP50637 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TspoP50637 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TspoP50637 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TspoP50637 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TspoP50637 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TspoP50637 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TspoP50637 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TspoP50637 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TspoP50637 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TspoP50637 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TspoP50637 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TspoP50637 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TspoP50637 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TspoP50637 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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TspoP50637 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TspoP50637 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TspoP50637 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TspoP50637 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TspoP50637 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TspoP50637 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TspoP50637 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TspoP50637 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TspoP50637 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TspoP50637 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TspoP50637 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TspoP50637 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TspoP50637 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TspoP50637 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TspoP50637 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TspoP50637 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TspoP50637 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TspoP50637 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TspoP50637 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TspoP50637 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TspoP50637 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TspoP50637 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TspoP50637 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TspoP50637 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TspoP50637 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TspoP50637 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TspoP50637 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TspoP50637 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TspoP50637 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TspoP50637 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms