Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SftpdP50404 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SftpdP50404 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SftpdP50404 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SftpdP50404 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SftpdP50404 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SftpdP50404 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SftpdP50404 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SftpdP50404 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SftpdP50404 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SftpdP50404 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SftpdP50404 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SftpdP50404 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SftpdP50404 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SftpdP50404 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SftpdP50404 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SftpdP50404 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SftpdP50404 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SftpdP50404 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SftpdP50404 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SftpdP50404 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SftpdP50404 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SftpdP50404 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SftpdP50404 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SftpdP50404 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SftpdP50404 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SftpdP50404 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SftpdP50404 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SftpdP50404 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SftpdP50404 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SftpdP50404 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SftpdP50404 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SftpdP50404 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SftpdP50404 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SftpdP50404 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SftpdP50404 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SftpdP50404 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SftpdP50404 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SftpdP50404 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SftpdP50404 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SftpdP50404 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SftpdP50404 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SftpdP50404 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SftpdP50404 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SftpdP50404 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SftpdP50404 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SftpdP50404 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SftpdP50404 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SftpdP50404 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SftpdP50404 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SftpdP50404 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SftpdP50404 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SftpdP50404 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SftpdP50404 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SftpdP50404 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SftpdP50404 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SftpdP50404 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SftpdP50404 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SftpdP50404 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SftpdP50404 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SftpdP50404 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SftpdP50404 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SftpdP50404 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SftpdP50404 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SftpdP50404 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SftpdP50404 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SftpdP50404 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SftpdP50404 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SftpdP50404 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SftpdP50404 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SftpdP50404 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SftpdP50404 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SftpdP50404 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SftpdP50404 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SftpdP50404 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SftpdP50404 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SftpdP50404 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SftpdP50404 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SftpdP50404 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SftpdP50404 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SftpdP50404 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SftpdP50404 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SftpdP50404 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SftpdP50404 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SftpdP50404 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SftpdP50404 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SftpdP50404 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SftpdP50404 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SftpdP50404 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SftpdP50404 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SftpdP50404 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SftpdP50404 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SftpdP50404 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SftpdP50404 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SftpdP50404 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SftpdP50404 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SftpdP50404 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SftpdP50404 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SftpdP50404 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SftpdP50404 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms