Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LtbrP50284 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
LtbrP50284 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LtbrP50284 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
LtbrP50284 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LtbrP50284 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LtbrP50284 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LtbrP50284 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LtbrP50284 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LtbrP50284 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LtbrP50284 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LtbrP50284 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LtbrP50284 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LtbrP50284 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
LtbrP50284 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LtbrP50284 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LtbrP50284 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LtbrP50284 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LtbrP50284 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LtbrP50284 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LtbrP50284 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LtbrP50284 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LtbrP50284 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LtbrP50284 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LtbrP50284 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LtbrP50284 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
LtbrP50284 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LtbrP50284 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LtbrP50284 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
LtbrP50284 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LtbrP50284 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LtbrP50284 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LtbrP50284 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LtbrP50284 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LtbrP50284 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LtbrP50284 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LtbrP50284 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LtbrP50284 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LtbrP50284 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LtbrP50284 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LtbrP50284 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LtbrP50284 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LtbrP50284 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LtbrP50284 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LtbrP50284 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LtbrP50284 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LtbrP50284 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LtbrP50284 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
LtbrP50284 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LtbrP50284 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
LtbrP50284 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LtbrP50284 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LtbrP50284 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LtbrP50284 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LtbrP50284 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LtbrP50284 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LtbrP50284 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LtbrP50284 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LtbrP50284 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LtbrP50284 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LtbrP50284 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LtbrP50284 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LtbrP50284 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
LtbrP50284 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
LtbrP50284 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LtbrP50284 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LtbrP50284 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LtbrP50284 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LtbrP50284 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LtbrP50284 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LtbrP50284 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LtbrP50284 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LtbrP50284 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LtbrP50284 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LtbrP50284 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LtbrP50284 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LtbrP50284 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LtbrP50284 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LtbrP50284 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LtbrP50284 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LtbrP50284 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LtbrP50284 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
LtbrP50284 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LtbrP50284 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LtbrP50284 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LtbrP50284 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LtbrP50284 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LtbrP50284 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LtbrP50284 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LtbrP50284 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LtbrP50284 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LtbrP50284 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LtbrP50284 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LtbrP50284 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LtbrP50284 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LtbrP50284 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LtbrP50284 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LtbrP50284 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LtbrP50284 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LtbrP50284 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms