Protein–RNA interactions for Protein: P49660

Sstr4, Somatostatin receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sstr4P49660 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Sstr4P49660 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sstr4P49660 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sstr4P49660 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sstr4P49660 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sstr4P49660 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sstr4P49660 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sstr4P49660 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sstr4P49660 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sstr4P49660 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sstr4P49660 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sstr4P49660 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sstr4P49660 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sstr4P49660 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sstr4P49660 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sstr4P49660 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sstr4P49660 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sstr4P49660 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sstr4P49660 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sstr4P49660 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sstr4P49660 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sstr4P49660 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sstr4P49660 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sstr4P49660 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sstr4P49660 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sstr4P49660 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sstr4P49660 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sstr4P49660 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sstr4P49660 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Sstr4P49660 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sstr4P49660 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Sstr4P49660 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sstr4P49660 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sstr4P49660 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sstr4P49660 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sstr4P49660 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sstr4P49660 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sstr4P49660 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Sstr4P49660 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Sstr4P49660 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sstr4P49660 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sstr4P49660 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sstr4P49660 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sstr4P49660 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sstr4P49660 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sstr4P49660 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sstr4P49660 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sstr4P49660 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sstr4P49660 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sstr4P49660 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sstr4P49660 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sstr4P49660 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sstr4P49660 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sstr4P49660 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sstr4P49660 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sstr4P49660 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sstr4P49660 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sstr4P49660 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sstr4P49660 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sstr4P49660 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sstr4P49660 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Sstr4P49660 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sstr4P49660 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sstr4P49660 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sstr4P49660 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sstr4P49660 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sstr4P49660 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sstr4P49660 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sstr4P49660 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sstr4P49660 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sstr4P49660 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sstr4P49660 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sstr4P49660 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sstr4P49660 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sstr4P49660 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sstr4P49660 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sstr4P49660 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sstr4P49660 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sstr4P49660 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Sstr4P49660 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sstr4P49660 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sstr4P49660 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sstr4P49660 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sstr4P49660 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sstr4P49660 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sstr4P49660 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sstr4P49660 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sstr4P49660 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sstr4P49660 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sstr4P49660 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sstr4P49660 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sstr4P49660 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sstr4P49660 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sstr4P49660 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sstr4P49660 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sstr4P49660 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sstr4P49660 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sstr4P49660 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sstr4P49660 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sstr4P49660 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms