Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tnni3P48787 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tnni3P48787 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tnni3P48787 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tnni3P48787 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tnni3P48787 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tnni3P48787 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tnni3P48787 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tnni3P48787 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tnni3P48787 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tnni3P48787 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tnni3P48787 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tnni3P48787 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tnni3P48787 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tnni3P48787 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tnni3P48787 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tnni3P48787 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tnni3P48787 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tnni3P48787 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tnni3P48787 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tnni3P48787 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tnni3P48787 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tnni3P48787 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tnni3P48787 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tnni3P48787 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tnni3P48787 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tnni3P48787 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnni3P48787 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnni3P48787 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnni3P48787 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnni3P48787 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnni3P48787 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnni3P48787 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnni3P48787 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnni3P48787 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnni3P48787 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnni3P48787 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnni3P48787 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnni3P48787 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnni3P48787 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnni3P48787 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnni3P48787 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnni3P48787 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnni3P48787 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tnni3P48787 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tnni3P48787 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tnni3P48787 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tnni3P48787 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tnni3P48787 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tnni3P48787 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnni3P48787 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnni3P48787 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnni3P48787 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnni3P48787 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnni3P48787 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnni3P48787 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnni3P48787 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnni3P48787 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnni3P48787 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnni3P48787 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnni3P48787 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnni3P48787 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnni3P48787 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnni3P48787 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnni3P48787 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnni3P48787 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tnni3P48787 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tnni3P48787 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tnni3P48787 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tnni3P48787 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tnni3P48787 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tnni3P48787 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tnni3P48787 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tnni3P48787 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tnni3P48787 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tnni3P48787 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Tnni3P48787 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Tnni3P48787 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Tnni3P48787 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tnni3P48787 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tnni3P48787 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Tnni3P48787 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnni3P48787 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnni3P48787 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnni3P48787 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnni3P48787 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnni3P48787 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnni3P48787 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnni3P48787 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnni3P48787 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnni3P48787 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnni3P48787 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnni3P48787 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnni3P48787 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnni3P48787 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnni3P48787 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnni3P48787 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnni3P48787 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnni3P48787 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnni3P48787 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms