Protein–RNA interactions for Protein: P47739

Aldh3a1, Aldehyde dehydrogenase, dimeric NADP-preferring, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh3a1P47739 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Aldh3a1P47739 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Aldh3a1P47739 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Aldh3a1P47739 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Aldh3a1P47739 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Aldh3a1P47739 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Aldh3a1P47739 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Aldh3a1P47739 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Aldh3a1P47739 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Aldh3a1P47739 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aldh3a1P47739 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aldh3a1P47739 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Aldh3a1P47739 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Aldh3a1P47739 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Aldh3a1P47739 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Aldh3a1P47739 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Aldh3a1P47739 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Aldh3a1P47739 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Aldh3a1P47739 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Aldh3a1P47739 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Aldh3a1P47739 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Aldh3a1P47739 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Aldh3a1P47739 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Aldh3a1P47739 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Aldh3a1P47739 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Aldh3a1P47739 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Aldh3a1P47739 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Aldh3a1P47739 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Aldh3a1P47739 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Aldh3a1P47739 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Aldh3a1P47739 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aldh3a1P47739 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aldh3a1P47739 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aldh3a1P47739 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aldh3a1P47739 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aldh3a1P47739 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aldh3a1P47739 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aldh3a1P47739 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aldh3a1P47739 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Aldh3a1P47739 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aldh3a1P47739 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aldh3a1P47739 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aldh3a1P47739 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Aldh3a1P47739 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Aldh3a1P47739 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Aldh3a1P47739 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Aldh3a1P47739 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Aldh3a1P47739 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Aldh3a1P47739 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Aldh3a1P47739 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Aldh3a1P47739 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Aldh3a1P47739 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Aldh3a1P47739 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Aldh3a1P47739 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Aldh3a1P47739 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Aldh3a1P47739 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Aldh3a1P47739 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Aldh3a1P47739 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Aldh3a1P47739 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Aldh3a1P47739 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Aldh3a1P47739 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Aldh3a1P47739 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Aldh3a1P47739 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Aldh3a1P47739 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Aldh3a1P47739 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Aldh3a1P47739 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Aldh3a1P47739 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Aldh3a1P47739 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Aldh3a1P47739 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Aldh3a1P47739 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Aldh3a1P47739 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Aldh3a1P47739 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Aldh3a1P47739 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Aldh3a1P47739 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Aldh3a1P47739 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Aldh3a1P47739 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Aldh3a1P47739 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Aldh3a1P47739 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Aldh3a1P47739 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Aldh3a1P47739 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Aldh3a1P47739 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Aldh3a1P47739 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Aldh3a1P47739 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Aldh3a1P47739 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Aldh3a1P47739 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Aldh3a1P47739 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Aldh3a1P47739 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Aldh3a1P47739 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Aldh3a1P47739 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Aldh3a1P47739 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Aldh3a1P47739 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Aldh3a1P47739 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Aldh3a1P47739 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Aldh3a1P47739 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Aldh3a1P47739 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Aldh3a1P47739 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Aldh3a1P47739 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Aldh3a1P47739 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Aldh3a1P47739 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Aldh3a1P47739 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms