Protein–RNA interactions for Protein: P46978

Stt3a, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit STT3A, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stt3aP46978 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Stt3aP46978 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stt3aP46978 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stt3aP46978 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stt3aP46978 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stt3aP46978 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stt3aP46978 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stt3aP46978 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Stt3aP46978 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stt3aP46978 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stt3aP46978 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stt3aP46978 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stt3aP46978 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stt3aP46978 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stt3aP46978 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Stt3aP46978 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Stt3aP46978 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stt3aP46978 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stt3aP46978 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stt3aP46978 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stt3aP46978 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stt3aP46978 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Stt3aP46978 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stt3aP46978 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stt3aP46978 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stt3aP46978 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stt3aP46978 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Stt3aP46978 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stt3aP46978 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Stt3aP46978 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stt3aP46978 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stt3aP46978 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stt3aP46978 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stt3aP46978 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Stt3aP46978 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stt3aP46978 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stt3aP46978 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Stt3aP46978 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stt3aP46978 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stt3aP46978 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Stt3aP46978 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stt3aP46978 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stt3aP46978 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stt3aP46978 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stt3aP46978 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stt3aP46978 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stt3aP46978 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stt3aP46978 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stt3aP46978 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stt3aP46978 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stt3aP46978 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stt3aP46978 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Stt3aP46978 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stt3aP46978 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stt3aP46978 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stt3aP46978 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stt3aP46978 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stt3aP46978 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stt3aP46978 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stt3aP46978 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stt3aP46978 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stt3aP46978 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stt3aP46978 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stt3aP46978 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stt3aP46978 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stt3aP46978 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stt3aP46978 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stt3aP46978 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stt3aP46978 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stt3aP46978 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stt3aP46978 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stt3aP46978 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stt3aP46978 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stt3aP46978 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Stt3aP46978 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Stt3aP46978 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stt3aP46978 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stt3aP46978 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stt3aP46978 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Stt3aP46978 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stt3aP46978 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stt3aP46978 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Stt3aP46978 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stt3aP46978 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stt3aP46978 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stt3aP46978 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stt3aP46978 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stt3aP46978 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stt3aP46978 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stt3aP46978 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stt3aP46978 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stt3aP46978 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stt3aP46978 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stt3aP46978 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stt3aP46978 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stt3aP46978 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stt3aP46978 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stt3aP46978 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stt3aP46978 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stt3aP46978 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms