Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rab11bP46638 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rab11bP46638 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rab11bP46638 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rab11bP46638 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rab11bP46638 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rab11bP46638 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rab11bP46638 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rab11bP46638 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rab11bP46638 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rab11bP46638 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rab11bP46638 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rab11bP46638 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rab11bP46638 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rab11bP46638 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rab11bP46638 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Rab11bP46638 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rab11bP46638 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rab11bP46638 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rab11bP46638 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rab11bP46638 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rab11bP46638 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rab11bP46638 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rab11bP46638 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rab11bP46638 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rab11bP46638 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rab11bP46638 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rab11bP46638 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rab11bP46638 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rab11bP46638 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rab11bP46638 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rab11bP46638 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rab11bP46638 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rab11bP46638 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rab11bP46638 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rab11bP46638 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rab11bP46638 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rab11bP46638 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rab11bP46638 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rab11bP46638 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rab11bP46638 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rab11bP46638 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rab11bP46638 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rab11bP46638 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rab11bP46638 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rab11bP46638 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rab11bP46638 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rab11bP46638 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rab11bP46638 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rab11bP46638 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rab11bP46638 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rab11bP46638 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rab11bP46638 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rab11bP46638 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Rab11bP46638 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rab11bP46638 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rab11bP46638 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rab11bP46638 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rab11bP46638 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rab11bP46638 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rab11bP46638 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rab11bP46638 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab11bP46638 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab11bP46638 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab11bP46638 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab11bP46638 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab11bP46638 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab11bP46638 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab11bP46638 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rab11bP46638 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rab11bP46638 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rab11bP46638 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rab11bP46638 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rab11bP46638 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rab11bP46638 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rab11bP46638 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rab11bP46638 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rab11bP46638 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rab11bP46638 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rab11bP46638 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rab11bP46638 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rab11bP46638 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rab11bP46638 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rab11bP46638 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rab11bP46638 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rab11bP46638 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rab11bP46638 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rab11bP46638 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rab11bP46638 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rab11bP46638 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rab11bP46638 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rab11bP46638 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rab11bP46638 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rab11bP46638 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rab11bP46638 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rab11bP46638 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rab11bP46638 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rab11bP46638 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rab11bP46638 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rab11bP46638 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms