Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ItgavP43406 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ItgavP43406 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ItgavP43406 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ItgavP43406 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ItgavP43406 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ItgavP43406 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ItgavP43406 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ItgavP43406 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ItgavP43406 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ItgavP43406 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ItgavP43406 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ItgavP43406 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ItgavP43406 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ItgavP43406 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ItgavP43406 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ItgavP43406 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ItgavP43406 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ItgavP43406 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ItgavP43406 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ItgavP43406 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ItgavP43406 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ItgavP43406 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ItgavP43406 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ItgavP43406 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ItgavP43406 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ItgavP43406 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ItgavP43406 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ItgavP43406 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ItgavP43406 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ItgavP43406 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ItgavP43406 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ItgavP43406 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ItgavP43406 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ItgavP43406 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ItgavP43406 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ItgavP43406 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ItgavP43406 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ItgavP43406 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ItgavP43406 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ItgavP43406 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ItgavP43406 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ItgavP43406 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ItgavP43406 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ItgavP43406 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ItgavP43406 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ItgavP43406 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ItgavP43406 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ItgavP43406 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ItgavP43406 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ItgavP43406 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ItgavP43406 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ItgavP43406 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ItgavP43406 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ItgavP43406 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ItgavP43406 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ItgavP43406 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ItgavP43406 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ItgavP43406 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ItgavP43406 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ItgavP43406 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ItgavP43406 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ItgavP43406 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ItgavP43406 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ItgavP43406 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ItgavP43406 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ItgavP43406 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ItgavP43406 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ItgavP43406 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ItgavP43406 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ItgavP43406 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ItgavP43406 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ItgavP43406 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ItgavP43406 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ItgavP43406 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ItgavP43406 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ItgavP43406 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ItgavP43406 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ItgavP43406 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ItgavP43406 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ItgavP43406 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ItgavP43406 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ItgavP43406 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ItgavP43406 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ItgavP43406 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ItgavP43406 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ItgavP43406 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ItgavP43406 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ItgavP43406 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ItgavP43406 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ItgavP43406 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ItgavP43406 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ItgavP43406 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ItgavP43406 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ItgavP43406 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ItgavP43406 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ItgavP43406 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ItgavP43406 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ItgavP43406 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ItgavP43406 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.8 ms