Protein–RNA interactions for Protein: P43029

Gdf7, Growth/differentiation factor 7, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf7P43029 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gdf7P43029 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gdf7P43029 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gdf7P43029 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gdf7P43029 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gdf7P43029 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gdf7P43029 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gdf7P43029 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gdf7P43029 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gdf7P43029 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gdf7P43029 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gdf7P43029 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gdf7P43029 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Gdf7P43029 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gdf7P43029 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gdf7P43029 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gdf7P43029 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gdf7P43029 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gdf7P43029 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gdf7P43029 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gdf7P43029 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gdf7P43029 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gdf7P43029 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Gdf7P43029 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gdf7P43029 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gdf7P43029 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gdf7P43029 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gdf7P43029 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gdf7P43029 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Gdf7P43029 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gdf7P43029 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gdf7P43029 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gdf7P43029 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gdf7P43029 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gdf7P43029 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gdf7P43029 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gdf7P43029 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gdf7P43029 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gdf7P43029 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gdf7P43029 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gdf7P43029 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gdf7P43029 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gdf7P43029 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gdf7P43029 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gdf7P43029 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gdf7P43029 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gdf7P43029 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gdf7P43029 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Gdf7P43029 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gdf7P43029 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gdf7P43029 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gdf7P43029 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gdf7P43029 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gdf7P43029 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gdf7P43029 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gdf7P43029 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gdf7P43029 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gdf7P43029 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gdf7P43029 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gdf7P43029 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gdf7P43029 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gdf7P43029 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Gdf7P43029 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gdf7P43029 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gdf7P43029 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gdf7P43029 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gdf7P43029 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gdf7P43029 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gdf7P43029 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gdf7P43029 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gdf7P43029 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gdf7P43029 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gdf7P43029 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gdf7P43029 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gdf7P43029 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gdf7P43029 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gdf7P43029 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gdf7P43029 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gdf7P43029 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gdf7P43029 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gdf7P43029 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Gdf7P43029 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gdf7P43029 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gdf7P43029 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gdf7P43029 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gdf7P43029 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gdf7P43029 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gdf7P43029 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gdf7P43029 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gdf7P43029 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gdf7P43029 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gdf7P43029 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gdf7P43029 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Gdf7P43029 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gdf7P43029 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gdf7P43029 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gdf7P43029 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gdf7P43029 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gdf7P43029 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gdf7P43029 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101 ms