Protein–RNA interactions for Protein: P41438

Slc19a1, Folate transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc19a1P41438 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc19a1P41438 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc19a1P41438 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc19a1P41438 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc19a1P41438 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc19a1P41438 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc19a1P41438 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc19a1P41438 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc19a1P41438 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc19a1P41438 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc19a1P41438 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc19a1P41438 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc19a1P41438 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc19a1P41438 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc19a1P41438 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc19a1P41438 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc19a1P41438 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc19a1P41438 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc19a1P41438 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc19a1P41438 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc19a1P41438 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc19a1P41438 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc19a1P41438 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc19a1P41438 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc19a1P41438 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc19a1P41438 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc19a1P41438 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc19a1P41438 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc19a1P41438 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc19a1P41438 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc19a1P41438 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc19a1P41438 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc19a1P41438 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc19a1P41438 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc19a1P41438 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc19a1P41438 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc19a1P41438 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc19a1P41438 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc19a1P41438 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc19a1P41438 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc19a1P41438 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc19a1P41438 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc19a1P41438 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc19a1P41438 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc19a1P41438 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc19a1P41438 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc19a1P41438 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc19a1P41438 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc19a1P41438 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc19a1P41438 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc19a1P41438 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc19a1P41438 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc19a1P41438 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc19a1P41438 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc19a1P41438 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc19a1P41438 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc19a1P41438 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc19a1P41438 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc19a1P41438 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc19a1P41438 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc19a1P41438 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc19a1P41438 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc19a1P41438 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc19a1P41438 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc19a1P41438 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc19a1P41438 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc19a1P41438 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc19a1P41438 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc19a1P41438 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Slc19a1P41438 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc19a1P41438 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc19a1P41438 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Slc19a1P41438 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc19a1P41438 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc19a1P41438 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc19a1P41438 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc19a1P41438 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc19a1P41438 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc19a1P41438 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc19a1P41438 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc19a1P41438 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc19a1P41438 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc19a1P41438 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc19a1P41438 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc19a1P41438 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc19a1P41438 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc19a1P41438 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc19a1P41438 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc19a1P41438 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc19a1P41438 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc19a1P41438 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc19a1P41438 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc19a1P41438 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Slc19a1P41438 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Slc19a1P41438 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Slc19a1P41438 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc19a1P41438 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc19a1P41438 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc19a1P41438 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc19a1P41438 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms