Protein–RNA interactions for Protein: P41164

Etv1, ETS translocation variant 1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv1P41164 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Etv1P41164 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Etv1P41164 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Etv1P41164 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Etv1P41164 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Etv1P41164 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Etv1P41164 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Etv1P41164 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Etv1P41164 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Etv1P41164 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Etv1P41164 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Etv1P41164 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Etv1P41164 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Etv1P41164 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Etv1P41164 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Etv1P41164 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Etv1P41164 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Etv1P41164 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Etv1P41164 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Etv1P41164 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Etv1P41164 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Etv1P41164 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Etv1P41164 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Etv1P41164 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Etv1P41164 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Etv1P41164 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Etv1P41164 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Etv1P41164 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Etv1P41164 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Etv1P41164 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Etv1P41164 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Etv1P41164 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Etv1P41164 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Etv1P41164 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Etv1P41164 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Etv1P41164 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Etv1P41164 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Etv1P41164 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Etv1P41164 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Etv1P41164 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Etv1P41164 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Etv1P41164 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Etv1P41164 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Etv1P41164 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Etv1P41164 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Etv1P41164 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Etv1P41164 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Etv1P41164 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Etv1P41164 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Etv1P41164 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Etv1P41164 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Etv1P41164 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Etv1P41164 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Etv1P41164 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Etv1P41164 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Etv1P41164 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Etv1P41164 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Etv1P41164 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Etv1P41164 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Etv1P41164 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Etv1P41164 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Etv1P41164 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Etv1P41164 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Etv1P41164 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Etv1P41164 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Etv1P41164 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Etv1P41164 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Etv1P41164 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Etv1P41164 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Etv1P41164 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Etv1P41164 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Etv1P41164 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Etv1P41164 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Etv1P41164 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Etv1P41164 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Etv1P41164 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Etv1P41164 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Etv1P41164 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Etv1P41164 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Etv1P41164 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Etv1P41164 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Etv1P41164 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Etv1P41164 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Etv1P41164 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Etv1P41164 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Etv1P41164 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Etv1P41164 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Etv1P41164 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Etv1P41164 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Etv1P41164 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Etv1P41164 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Etv1P41164 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Etv1P41164 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Etv1P41164 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Etv1P41164 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Etv1P41164 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Etv1P41164 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Etv1P41164 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Etv1P41164 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Etv1P41164 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms