Protein–RNA interactions for Protein: P40223

Csf3r, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3rP40223 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Csf3rP40223 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Csf3rP40223 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Csf3rP40223 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Csf3rP40223 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Csf3rP40223 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Csf3rP40223 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Csf3rP40223 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Csf3rP40223 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Csf3rP40223 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Csf3rP40223 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Csf3rP40223 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Csf3rP40223 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Csf3rP40223 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Csf3rP40223 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Csf3rP40223 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Csf3rP40223 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Csf3rP40223 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Csf3rP40223 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Csf3rP40223 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Csf3rP40223 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Csf3rP40223 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Csf3rP40223 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Csf3rP40223 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Csf3rP40223 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Csf3rP40223 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Csf3rP40223 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Csf3rP40223 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Csf3rP40223 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Csf3rP40223 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Csf3rP40223 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Csf3rP40223 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Csf3rP40223 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Csf3rP40223 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Csf3rP40223 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Csf3rP40223 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Csf3rP40223 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Csf3rP40223 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Csf3rP40223 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Csf3rP40223 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Csf3rP40223 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Csf3rP40223 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Csf3rP40223 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Csf3rP40223 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Csf3rP40223 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Csf3rP40223 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Csf3rP40223 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Csf3rP40223 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Csf3rP40223 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Csf3rP40223 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Csf3rP40223 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Csf3rP40223 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Csf3rP40223 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Csf3rP40223 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Csf3rP40223 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Csf3rP40223 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Csf3rP40223 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Csf3rP40223 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Csf3rP40223 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Csf3rP40223 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Csf3rP40223 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Csf3rP40223 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Csf3rP40223 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Csf3rP40223 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Csf3rP40223 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Csf3rP40223 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Csf3rP40223 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Csf3rP40223 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Csf3rP40223 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Csf3rP40223 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Csf3rP40223 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Csf3rP40223 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Csf3rP40223 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Csf3rP40223 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Csf3rP40223 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Csf3rP40223 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Csf3rP40223 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Csf3rP40223 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Csf3rP40223 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Csf3rP40223 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Csf3rP40223 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Csf3rP40223 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Csf3rP40223 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Csf3rP40223 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Csf3rP40223 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Csf3rP40223 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Csf3rP40223 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Csf3rP40223 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Csf3rP40223 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Csf3rP40223 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Csf3rP40223 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csf3rP40223 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csf3rP40223 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csf3rP40223 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csf3rP40223 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csf3rP40223 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csf3rP40223 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csf3rP40223 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csf3rP40223 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Csf3rP40223 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms