Protein–RNA interactions for Protein: P35831

Ptpn12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, mousemouse

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn12P35831 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ptpn12P35831 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ptpn12P35831 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ptpn12P35831 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ptpn12P35831 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ptpn12P35831 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ptpn12P35831 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ptpn12P35831 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ptpn12P35831 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ptpn12P35831 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ptpn12P35831 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ptpn12P35831 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ptpn12P35831 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ptpn12P35831 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ptpn12P35831 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ptpn12P35831 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ptpn12P35831 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ptpn12P35831 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ptpn12P35831 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ptpn12P35831 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ptpn12P35831 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ptpn12P35831 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ptpn12P35831 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ptpn12P35831 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ptpn12P35831 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ptpn12P35831 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Ptpn12P35831 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ptpn12P35831 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ptpn12P35831 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ptpn12P35831 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ptpn12P35831 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Ptpn12P35831 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ptpn12P35831 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ptpn12P35831 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ptpn12P35831 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ptpn12P35831 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ptpn12P35831 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ptpn12P35831 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ptpn12P35831 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ptpn12P35831 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ptpn12P35831 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ptpn12P35831 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ptpn12P35831 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ptpn12P35831 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ptpn12P35831 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ptpn12P35831 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ptpn12P35831 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ptpn12P35831 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ptpn12P35831 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ptpn12P35831 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ptpn12P35831 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ptpn12P35831 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ptpn12P35831 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ptpn12P35831 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ptpn12P35831 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ptpn12P35831 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ptpn12P35831 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ptpn12P35831 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ptpn12P35831 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ptpn12P35831 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ptpn12P35831 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ptpn12P35831 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ptpn12P35831 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ptpn12P35831 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ptpn12P35831 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ptpn12P35831 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ptpn12P35831 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ptpn12P35831 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ptpn12P35831 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ptpn12P35831 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ptpn12P35831 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ptpn12P35831 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ptpn12P35831 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ptpn12P35831 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Ptpn12P35831 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ptpn12P35831 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ptpn12P35831 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Ptpn12P35831 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ptpn12P35831 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ptpn12P35831 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ptpn12P35831 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ptpn12P35831 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Ptpn12P35831 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ptpn12P35831 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ptpn12P35831 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ptpn12P35831 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ptpn12P35831 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ptpn12P35831 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ptpn12P35831 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ptpn12P35831 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ptpn12P35831 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ptpn12P35831 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ptpn12P35831 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ptpn12P35831 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ptpn12P35831 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ptpn12P35831 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ptpn12P35831 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ptpn12P35831 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ptpn12P35831 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ptpn12P35831 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms