Protein–RNA interactions for Protein: P35288

Rab23, Ras-related protein Rab-23, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab23P35288 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rab23P35288 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rab23P35288 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rab23P35288 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rab23P35288 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rab23P35288 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Rab23P35288 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rab23P35288 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rab23P35288 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab23P35288 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab23P35288 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab23P35288 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab23P35288 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab23P35288 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab23P35288 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab23P35288 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab23P35288 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab23P35288 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab23P35288 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab23P35288 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab23P35288 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab23P35288 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab23P35288 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab23P35288 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab23P35288 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab23P35288 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab23P35288 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab23P35288 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rab23P35288 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rab23P35288 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rab23P35288 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Rab23P35288 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rab23P35288 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab23P35288 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab23P35288 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab23P35288 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab23P35288 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab23P35288 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab23P35288 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab23P35288 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab23P35288 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab23P35288 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab23P35288 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab23P35288 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab23P35288 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab23P35288 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab23P35288 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab23P35288 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab23P35288 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab23P35288 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab23P35288 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rab23P35288 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rab23P35288 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab23P35288 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab23P35288 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab23P35288 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab23P35288 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab23P35288 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab23P35288 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab23P35288 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab23P35288 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab23P35288 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab23P35288 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab23P35288 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab23P35288 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab23P35288 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab23P35288 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab23P35288 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab23P35288 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rab23P35288 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rab23P35288 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab23P35288 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab23P35288 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab23P35288 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab23P35288 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab23P35288 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab23P35288 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab23P35288 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab23P35288 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab23P35288 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab23P35288 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab23P35288 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab23P35288 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab23P35288 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rab23P35288 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab23P35288 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab23P35288 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab23P35288 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab23P35288 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab23P35288 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab23P35288 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab23P35288 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab23P35288 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab23P35288 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab23P35288 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab23P35288 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab23P35288 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab23P35288 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab23P35288 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rab23P35288 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms