Protein–RNA interactions for Protein: P33611

Pola2, DNA polymerase alpha subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola2P33611 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pola2P33611 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Pola2P33611 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pola2P33611 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pola2P33611 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pola2P33611 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pola2P33611 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pola2P33611 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pola2P33611 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pola2P33611 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pola2P33611 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pola2P33611 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pola2P33611 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pola2P33611 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pola2P33611 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pola2P33611 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pola2P33611 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pola2P33611 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pola2P33611 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pola2P33611 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pola2P33611 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pola2P33611 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Pola2P33611 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pola2P33611 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pola2P33611 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pola2P33611 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pola2P33611 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pola2P33611 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pola2P33611 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pola2P33611 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pola2P33611 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pola2P33611 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pola2P33611 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pola2P33611 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pola2P33611 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pola2P33611 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pola2P33611 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pola2P33611 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Pola2P33611 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pola2P33611 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pola2P33611 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pola2P33611 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pola2P33611 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pola2P33611 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pola2P33611 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pola2P33611 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pola2P33611 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pola2P33611 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pola2P33611 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pola2P33611 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pola2P33611 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pola2P33611 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pola2P33611 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Pola2P33611 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pola2P33611 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pola2P33611 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pola2P33611 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pola2P33611 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pola2P33611 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pola2P33611 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pola2P33611 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pola2P33611 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pola2P33611 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pola2P33611 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Pola2P33611 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pola2P33611 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pola2P33611 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Pola2P33611 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pola2P33611 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pola2P33611 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pola2P33611 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pola2P33611 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pola2P33611 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pola2P33611 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pola2P33611 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pola2P33611 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pola2P33611 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pola2P33611 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pola2P33611 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Pola2P33611 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pola2P33611 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pola2P33611 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pola2P33611 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pola2P33611 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pola2P33611 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pola2P33611 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pola2P33611 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pola2P33611 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pola2P33611 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pola2P33611 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pola2P33611 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pola2P33611 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pola2P33611 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pola2P33611 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pola2P33611 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pola2P33611 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pola2P33611 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pola2P33611 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pola2P33611 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pola2P33611 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms