Protein–RNA interactions for Protein: P33146

Cdh15, Cadherin-15, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh15P33146 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdh15P33146 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdh15P33146 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdh15P33146 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdh15P33146 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Cdh15P33146 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cdh15P33146 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cdh15P33146 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdh15P33146 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdh15P33146 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdh15P33146 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdh15P33146 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdh15P33146 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdh15P33146 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdh15P33146 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdh15P33146 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdh15P33146 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdh15P33146 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdh15P33146 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdh15P33146 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdh15P33146 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdh15P33146 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdh15P33146 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdh15P33146 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdh15P33146 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdh15P33146 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdh15P33146 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdh15P33146 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdh15P33146 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdh15P33146 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdh15P33146 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdh15P33146 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdh15P33146 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdh15P33146 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdh15P33146 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdh15P33146 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdh15P33146 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdh15P33146 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdh15P33146 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdh15P33146 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdh15P33146 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdh15P33146 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdh15P33146 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdh15P33146 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdh15P33146 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdh15P33146 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdh15P33146 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdh15P33146 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdh15P33146 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdh15P33146 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdh15P33146 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdh15P33146 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdh15P33146 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdh15P33146 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdh15P33146 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdh15P33146 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdh15P33146 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdh15P33146 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdh15P33146 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdh15P33146 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdh15P33146 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdh15P33146 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdh15P33146 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdh15P33146 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdh15P33146 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdh15P33146 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdh15P33146 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdh15P33146 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdh15P33146 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdh15P33146 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdh15P33146 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdh15P33146 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdh15P33146 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdh15P33146 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdh15P33146 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdh15P33146 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdh15P33146 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdh15P33146 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdh15P33146 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdh15P33146 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdh15P33146 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdh15P33146 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdh15P33146 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdh15P33146 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdh15P33146 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdh15P33146 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdh15P33146 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdh15P33146 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdh15P33146 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdh15P33146 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdh15P33146 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdh15P33146 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdh15P33146 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdh15P33146 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdh15P33146 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdh15P33146 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdh15P33146 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdh15P33146 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdh15P33146 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cdh15P33146 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms