Protein–RNA interactions for Protein: P30285

Cdk4, Cyclin-dependent kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk4P30285 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdk4P30285 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdk4P30285 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdk4P30285 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdk4P30285 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdk4P30285 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdk4P30285 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdk4P30285 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdk4P30285 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdk4P30285 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdk4P30285 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdk4P30285 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdk4P30285 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdk4P30285 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdk4P30285 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdk4P30285 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdk4P30285 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdk4P30285 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdk4P30285 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdk4P30285 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdk4P30285 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdk4P30285 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdk4P30285 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdk4P30285 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdk4P30285 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdk4P30285 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdk4P30285 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdk4P30285 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdk4P30285 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdk4P30285 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdk4P30285 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdk4P30285 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdk4P30285 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdk4P30285 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdk4P30285 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdk4P30285 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdk4P30285 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdk4P30285 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdk4P30285 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdk4P30285 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdk4P30285 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdk4P30285 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdk4P30285 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cdk4P30285 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdk4P30285 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdk4P30285 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdk4P30285 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdk4P30285 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdk4P30285 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdk4P30285 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdk4P30285 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdk4P30285 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdk4P30285 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdk4P30285 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdk4P30285 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdk4P30285 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdk4P30285 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdk4P30285 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdk4P30285 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdk4P30285 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdk4P30285 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdk4P30285 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdk4P30285 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdk4P30285 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdk4P30285 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdk4P30285 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdk4P30285 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdk4P30285 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdk4P30285 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdk4P30285 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdk4P30285 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdk4P30285 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdk4P30285 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdk4P30285 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cdk4P30285 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cdk4P30285 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdk4P30285 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdk4P30285 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdk4P30285 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdk4P30285 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdk4P30285 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdk4P30285 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdk4P30285 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdk4P30285 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdk4P30285 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdk4P30285 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdk4P30285 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdk4P30285 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdk4P30285 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdk4P30285 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdk4P30285 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdk4P30285 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cdk4P30285 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdk4P30285 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdk4P30285 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cdk4P30285 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdk4P30285 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdk4P30285 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdk4P30285 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdk4P30285 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.2 ms