Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Cnga1P29974 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Cnga1P29974 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Cnga1P29974 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Cnga1P29974 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Cnga1P29974 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Cnga1P29974 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Cnga1P29974 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Cnga1P29974 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Cnga1P29974 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Cnga1P29974 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Cnga1P29974 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Cnga1P29974 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Cnga1P29974 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Cnga1P29974 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Cnga1P29974 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Cnga1P29974 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Cnga1P29974 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Cnga1P29974 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Cnga1P29974 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Cnga1P29974 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Cnga1P29974 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Cnga1P29974 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Cnga1P29974 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Cnga1P29974 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Cnga1P29974 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Cnga1P29974 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Cnga1P29974 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Cnga1P29974 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Cnga1P29974 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Cnga1P29974 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Cnga1P29974 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Cnga1P29974 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Cnga1P29974 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Cnga1P29974 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Cnga1P29974 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Cnga1P29974 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Cnga1P29974 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Cnga1P29974 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Cnga1P29974 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Cnga1P29974 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Cnga1P29974 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Cnga1P29974 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Cnga1P29974 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Cnga1P29974 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Cnga1P29974 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Cnga1P29974 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Cnga1P29974 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Cnga1P29974 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Cnga1P29974 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
Cnga1P29974 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Cnga1P29974 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Cnga1P29974 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Cnga1P29974 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Cnga1P29974 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Cnga1P29974 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Cnga1P29974 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
Cnga1P29974 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Cnga1P29974 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Cnga1P29974 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Cnga1P29974 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
Cnga1P29974 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Cnga1P29974 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Cnga1P29974 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Cnga1P29974 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Cnga1P29974 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Cnga1P29974 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Cnga1P29974 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Cnga1P29974 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Cnga1P29974 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Cnga1P29974 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Cnga1P29974 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
Cnga1P29974 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Cnga1P29974 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Cnga1P29974 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Cnga1P29974 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Cnga1P29974 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Cnga1P29974 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Cnga1P29974 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Cnga1P29974 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Cnga1P29974 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Cnga1P29974 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Cnga1P29974 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Cnga1P29974 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Cnga1P29974 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Cnga1P29974 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Cnga1P29974 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Cnga1P29974 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Cnga1P29974 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Cnga1P29974 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
Cnga1P29974 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Cnga1P29974 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Cnga1P29974 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Cnga1P29974 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.49
Cnga1P29974 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Cnga1P29974 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Cnga1P29974 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Cnga1P29974 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Cnga1P29974 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Cnga1P29974 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms