Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PtprmP28828 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PtprmP28828 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PtprmP28828 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
PtprmP28828 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PtprmP28828 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PtprmP28828 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PtprmP28828 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PtprmP28828 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PtprmP28828 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PtprmP28828 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PtprmP28828 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PtprmP28828 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PtprmP28828 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PtprmP28828 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
PtprmP28828 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PtprmP28828 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PtprmP28828 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PtprmP28828 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PtprmP28828 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PtprmP28828 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
PtprmP28828 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PtprmP28828 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
PtprmP28828 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PtprmP28828 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PtprmP28828 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PtprmP28828 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PtprmP28828 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PtprmP28828 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PtprmP28828 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PtprmP28828 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PtprmP28828 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
PtprmP28828 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
PtprmP28828 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
PtprmP28828 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PtprmP28828 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PtprmP28828 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
PtprmP28828 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PtprmP28828 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
PtprmP28828 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PtprmP28828 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PtprmP28828 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PtprmP28828 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PtprmP28828 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PtprmP28828 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PtprmP28828 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PtprmP28828 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PtprmP28828 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PtprmP28828 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PtprmP28828 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PtprmP28828 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PtprmP28828 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PtprmP28828 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PtprmP28828 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
PtprmP28828 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PtprmP28828 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PtprmP28828 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
PtprmP28828 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
PtprmP28828 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PtprmP28828 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PtprmP28828 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PtprmP28828 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PtprmP28828 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PtprmP28828 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PtprmP28828 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PtprmP28828 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PtprmP28828 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PtprmP28828 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PtprmP28828 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PtprmP28828 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PtprmP28828 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
PtprmP28828 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PtprmP28828 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PtprmP28828 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PtprmP28828 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PtprmP28828 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PtprmP28828 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PtprmP28828 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PtprmP28828 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PtprmP28828 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PtprmP28828 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PtprmP28828 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PtprmP28828 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PtprmP28828 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
PtprmP28828 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PtprmP28828 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PtprmP28828 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PtprmP28828 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PtprmP28828 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PtprmP28828 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
PtprmP28828 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PtprmP28828 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PtprmP28828 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PtprmP28828 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PtprmP28828 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PtprmP28828 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PtprmP28828 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PtprmP28828 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PtprmP28828 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PtprmP28828 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
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