Protein–RNA interactions for Protein: P28798

Grn, Granulins, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GrnP28798 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GrnP28798 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GrnP28798 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GrnP28798 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GrnP28798 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GrnP28798 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GrnP28798 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GrnP28798 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GrnP28798 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GrnP28798 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GrnP28798 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GrnP28798 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GrnP28798 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GrnP28798 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GrnP28798 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GrnP28798 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GrnP28798 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GrnP28798 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GrnP28798 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GrnP28798 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GrnP28798 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GrnP28798 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GrnP28798 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GrnP28798 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GrnP28798 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GrnP28798 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GrnP28798 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GrnP28798 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GrnP28798 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GrnP28798 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GrnP28798 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GrnP28798 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GrnP28798 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GrnP28798 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GrnP28798 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GrnP28798 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GrnP28798 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GrnP28798 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GrnP28798 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GrnP28798 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GrnP28798 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GrnP28798 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GrnP28798 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GrnP28798 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GrnP28798 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GrnP28798 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GrnP28798 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GrnP28798 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GrnP28798 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GrnP28798 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GrnP28798 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GrnP28798 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GrnP28798 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GrnP28798 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GrnP28798 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GrnP28798 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GrnP28798 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GrnP28798 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GrnP28798 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GrnP28798 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GrnP28798 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GrnP28798 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GrnP28798 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GrnP28798 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GrnP28798 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GrnP28798 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GrnP28798 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GrnP28798 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GrnP28798 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GrnP28798 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GrnP28798 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GrnP28798 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GrnP28798 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GrnP28798 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GrnP28798 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GrnP28798 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GrnP28798 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GrnP28798 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GrnP28798 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GrnP28798 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GrnP28798 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GrnP28798 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GrnP28798 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GrnP28798 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GrnP28798 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GrnP28798 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GrnP28798 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GrnP28798 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GrnP28798 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GrnP28798 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GrnP28798 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GrnP28798 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GrnP28798 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GrnP28798 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GrnP28798 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GrnP28798 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GrnP28798 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GrnP28798 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GrnP28798 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GrnP28798 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms