Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NapbP28663 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NapbP28663 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NapbP28663 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NapbP28663 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NapbP28663 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NapbP28663 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NapbP28663 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NapbP28663 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NapbP28663 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NapbP28663 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NapbP28663 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NapbP28663 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
NapbP28663 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
NapbP28663 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NapbP28663 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
NapbP28663 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
NapbP28663 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NapbP28663 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NapbP28663 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NapbP28663 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NapbP28663 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NapbP28663 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NapbP28663 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NapbP28663 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NapbP28663 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NapbP28663 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NapbP28663 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NapbP28663 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NapbP28663 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NapbP28663 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NapbP28663 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
NapbP28663 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NapbP28663 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NapbP28663 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NapbP28663 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NapbP28663 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NapbP28663 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NapbP28663 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NapbP28663 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NapbP28663 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NapbP28663 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NapbP28663 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
NapbP28663 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
NapbP28663 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NapbP28663 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NapbP28663 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NapbP28663 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NapbP28663 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NapbP28663 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NapbP28663 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NapbP28663 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
NapbP28663 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
NapbP28663 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NapbP28663 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NapbP28663 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NapbP28663 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NapbP28663 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NapbP28663 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NapbP28663 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NapbP28663 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NapbP28663 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NapbP28663 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
NapbP28663 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NapbP28663 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
NapbP28663 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NapbP28663 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NapbP28663 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NapbP28663 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NapbP28663 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NapbP28663 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NapbP28663 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NapbP28663 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NapbP28663 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NapbP28663 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NapbP28663 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NapbP28663 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NapbP28663 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NapbP28663 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NapbP28663 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NapbP28663 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NapbP28663 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NapbP28663 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NapbP28663 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NapbP28663 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NapbP28663 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NapbP28663 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NapbP28663 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NapbP28663 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NapbP28663 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NapbP28663 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NapbP28663 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NapbP28663 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NapbP28663 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NapbP28663 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NapbP28663 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NapbP28663 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NapbP28663 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NapbP28663 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NapbP28663 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms