Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gjc1P28229 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gjc1P28229 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gjc1P28229 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gjc1P28229 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gjc1P28229 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gjc1P28229 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gjc1P28229 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gjc1P28229 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gjc1P28229 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gjc1P28229 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Gjc1P28229 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Gjc1P28229 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gjc1P28229 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gjc1P28229 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gjc1P28229 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gjc1P28229 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gjc1P28229 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gjc1P28229 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gjc1P28229 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gjc1P28229 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gjc1P28229 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Gjc1P28229 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gjc1P28229 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gjc1P28229 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gjc1P28229 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gjc1P28229 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gjc1P28229 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gjc1P28229 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gjc1P28229 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gjc1P28229 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Gjc1P28229 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Gjc1P28229 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gjc1P28229 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gjc1P28229 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gjc1P28229 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gjc1P28229 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gjc1P28229 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gjc1P28229 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gjc1P28229 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gjc1P28229 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gjc1P28229 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gjc1P28229 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gjc1P28229 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gjc1P28229 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gjc1P28229 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gjc1P28229 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gjc1P28229 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gjc1P28229 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gjc1P28229 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gjc1P28229 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gjc1P28229 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gjc1P28229 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gjc1P28229 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gjc1P28229 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gjc1P28229 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gjc1P28229 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gjc1P28229 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gjc1P28229 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gjc1P28229 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gjc1P28229 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gjc1P28229 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gjc1P28229 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gjc1P28229 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gjc1P28229 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gjc1P28229 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gjc1P28229 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gjc1P28229 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gjc1P28229 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gjc1P28229 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gjc1P28229 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gjc1P28229 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gjc1P28229 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gjc1P28229 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Gjc1P28229 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gjc1P28229 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gjc1P28229 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gjc1P28229 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gjc1P28229 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gjc1P28229 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gjc1P28229 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gjc1P28229 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gjc1P28229 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gjc1P28229 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gjc1P28229 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gjc1P28229 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gjc1P28229 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gjc1P28229 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gjc1P28229 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gjc1P28229 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Gjc1P28229 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gjc1P28229 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gjc1P28229 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gjc1P28229 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gjc1P28229 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gjc1P28229 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gjc1P28229 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gjc1P28229 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gjc1P28229 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gjc1P28229 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms