Protein–RNA interactions for Protein: P28078

H2-DMa, Class II histocompatibility antigen, M alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-DMaP28078 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2-DMaP28078 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2-DMaP28078 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2-DMaP28078 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2-DMaP28078 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2-DMaP28078 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2-DMaP28078 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2-DMaP28078 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2-DMaP28078 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2-DMaP28078 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H2-DMaP28078 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H2-DMaP28078 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H2-DMaP28078 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-DMaP28078 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-DMaP28078 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-DMaP28078 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-DMaP28078 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-DMaP28078 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-DMaP28078 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-DMaP28078 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
H2-DMaP28078 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
H2-DMaP28078 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
H2-DMaP28078 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2-DMaP28078 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2-DMaP28078 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
H2-DMaP28078 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2-DMaP28078 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2-DMaP28078 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2-DMaP28078 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-DMaP28078 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-DMaP28078 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-DMaP28078 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-DMaP28078 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-DMaP28078 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-DMaP28078 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-DMaP28078 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-DMaP28078 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-DMaP28078 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-DMaP28078 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-DMaP28078 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-DMaP28078 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-DMaP28078 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-DMaP28078 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-DMaP28078 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-DMaP28078 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-DMaP28078 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-DMaP28078 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-DMaP28078 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-DMaP28078 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-DMaP28078 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-DMaP28078 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-DMaP28078 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-DMaP28078 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-DMaP28078 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-DMaP28078 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-DMaP28078 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-DMaP28078 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-DMaP28078 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-DMaP28078 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-DMaP28078 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-DMaP28078 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-DMaP28078 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-DMaP28078 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-DMaP28078 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-DMaP28078 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-DMaP28078 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-DMaP28078 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-DMaP28078 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-DMaP28078 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2-DMaP28078 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2-DMaP28078 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
H2-DMaP28078 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2-DMaP28078 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2-DMaP28078 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2-DMaP28078 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2-DMaP28078 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2-DMaP28078 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2-DMaP28078 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2-DMaP28078 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2-DMaP28078 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
H2-DMaP28078 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2-DMaP28078 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2-DMaP28078 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
H2-DMaP28078 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
H2-DMaP28078 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
H2-DMaP28078 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
H2-DMaP28078 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2-DMaP28078 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
H2-DMaP28078 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2-DMaP28078 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2-DMaP28078 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2-DMaP28078 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2-DMaP28078 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2-DMaP28078 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2-DMaP28078 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-DMaP28078 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-DMaP28078 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-DMaP28078 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-DMaP28078 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-DMaP28078 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms