Protein–RNA interactions for Protein: P25976

Ubtf, Nucleolar transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbtfP25976 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC34.37■■■■□ 3.09
UbtfP25976 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
UbtfP25976 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC34.37■■■■□ 3.09
UbtfP25976 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
UbtfP25976 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
UbtfP25976 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
UbtfP25976 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
UbtfP25976 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
UbtfP25976 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
UbtfP25976 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
UbtfP25976 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
UbtfP25976 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
UbtfP25976 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
UbtfP25976 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
UbtfP25976 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
UbtfP25976 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
UbtfP25976 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
UbtfP25976 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
UbtfP25976 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.09
UbtfP25976 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
UbtfP25976 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
UbtfP25976 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
UbtfP25976 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
UbtfP25976 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
UbtfP25976 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
UbtfP25976 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
UbtfP25976 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
UbtfP25976 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
UbtfP25976 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
UbtfP25976 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
UbtfP25976 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
UbtfP25976 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
UbtfP25976 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC34.28■■■■□ 3.08
UbtfP25976 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
UbtfP25976 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
UbtfP25976 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
UbtfP25976 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
UbtfP25976 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
UbtfP25976 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
UbtfP25976 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
UbtfP25976 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
UbtfP25976 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
UbtfP25976 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
UbtfP25976 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
UbtfP25976 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
UbtfP25976 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
UbtfP25976 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
UbtfP25976 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
UbtfP25976 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
UbtfP25976 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
UbtfP25976 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
UbtfP25976 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
UbtfP25976 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
UbtfP25976 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
UbtfP25976 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
UbtfP25976 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
UbtfP25976 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
UbtfP25976 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
UbtfP25976 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
UbtfP25976 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC34.19■■■■□ 3.06
UbtfP25976 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
UbtfP25976 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
UbtfP25976 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
UbtfP25976 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
UbtfP25976 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
UbtfP25976 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
UbtfP25976 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
UbtfP25976 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
UbtfP25976 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
UbtfP25976 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
UbtfP25976 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
UbtfP25976 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
UbtfP25976 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
UbtfP25976 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
UbtfP25976 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
UbtfP25976 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
UbtfP25976 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
UbtfP25976 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
UbtfP25976 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
UbtfP25976 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
UbtfP25976 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
UbtfP25976 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
UbtfP25976 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
UbtfP25976 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
UbtfP25976 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
UbtfP25976 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
UbtfP25976 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
UbtfP25976 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
UbtfP25976 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
UbtfP25976 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
UbtfP25976 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
UbtfP25976 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
UbtfP25976 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
UbtfP25976 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
UbtfP25976 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
UbtfP25976 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
UbtfP25976 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
UbtfP25976 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
UbtfP25976 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
UbtfP25976 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms