Protein–RNA interactions for Protein: P25801

Lmo2, Rhombotin-2, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo2P25801 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lmo2P25801 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lmo2P25801 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lmo2P25801 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lmo2P25801 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lmo2P25801 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lmo2P25801 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Lmo2P25801 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lmo2P25801 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lmo2P25801 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lmo2P25801 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lmo2P25801 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lmo2P25801 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lmo2P25801 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lmo2P25801 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lmo2P25801 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lmo2P25801 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lmo2P25801 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lmo2P25801 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Lmo2P25801 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lmo2P25801 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lmo2P25801 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lmo2P25801 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lmo2P25801 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lmo2P25801 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lmo2P25801 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lmo2P25801 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lmo2P25801 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lmo2P25801 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lmo2P25801 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lmo2P25801 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Lmo2P25801 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Lmo2P25801 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Lmo2P25801 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lmo2P25801 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lmo2P25801 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lmo2P25801 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lmo2P25801 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lmo2P25801 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lmo2P25801 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lmo2P25801 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lmo2P25801 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lmo2P25801 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lmo2P25801 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lmo2P25801 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lmo2P25801 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lmo2P25801 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lmo2P25801 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lmo2P25801 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lmo2P25801 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lmo2P25801 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lmo2P25801 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lmo2P25801 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lmo2P25801 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Lmo2P25801 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Lmo2P25801 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Lmo2P25801 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lmo2P25801 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmo2P25801 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmo2P25801 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmo2P25801 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmo2P25801 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmo2P25801 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lmo2P25801 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lmo2P25801 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lmo2P25801 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lmo2P25801 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lmo2P25801 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lmo2P25801 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lmo2P25801 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lmo2P25801 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lmo2P25801 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lmo2P25801 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lmo2P25801 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lmo2P25801 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lmo2P25801 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lmo2P25801 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lmo2P25801 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lmo2P25801 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lmo2P25801 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lmo2P25801 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lmo2P25801 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lmo2P25801 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lmo2P25801 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lmo2P25801 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lmo2P25801 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lmo2P25801 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lmo2P25801 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lmo2P25801 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lmo2P25801 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lmo2P25801 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lmo2P25801 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lmo2P25801 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lmo2P25801 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lmo2P25801 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lmo2P25801 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lmo2P25801 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lmo2P25801 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lmo2P25801 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lmo2P25801 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms