Protein–RNA interactions for Protein: P23738

Hdc, Histidine decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HdcP23738 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HdcP23738 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HdcP23738 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HdcP23738 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HdcP23738 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HdcP23738 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HdcP23738 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HdcP23738 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HdcP23738 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HdcP23738 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HdcP23738 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HdcP23738 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HdcP23738 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HdcP23738 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HdcP23738 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HdcP23738 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HdcP23738 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HdcP23738 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HdcP23738 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HdcP23738 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HdcP23738 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HdcP23738 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HdcP23738 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HdcP23738 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HdcP23738 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HdcP23738 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HdcP23738 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HdcP23738 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HdcP23738 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HdcP23738 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HdcP23738 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HdcP23738 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HdcP23738 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HdcP23738 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HdcP23738 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HdcP23738 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HdcP23738 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HdcP23738 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HdcP23738 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HdcP23738 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HdcP23738 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HdcP23738 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HdcP23738 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HdcP23738 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HdcP23738 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HdcP23738 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HdcP23738 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HdcP23738 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HdcP23738 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HdcP23738 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HdcP23738 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HdcP23738 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HdcP23738 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HdcP23738 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HdcP23738 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HdcP23738 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HdcP23738 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HdcP23738 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HdcP23738 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HdcP23738 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HdcP23738 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HdcP23738 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HdcP23738 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HdcP23738 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HdcP23738 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HdcP23738 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HdcP23738 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HdcP23738 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HdcP23738 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HdcP23738 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HdcP23738 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HdcP23738 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HdcP23738 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HdcP23738 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HdcP23738 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HdcP23738 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HdcP23738 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HdcP23738 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HdcP23738 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HdcP23738 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HdcP23738 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HdcP23738 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HdcP23738 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HdcP23738 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HdcP23738 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HdcP23738 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HdcP23738 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HdcP23738 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HdcP23738 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HdcP23738 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HdcP23738 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HdcP23738 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HdcP23738 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HdcP23738 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HdcP23738 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HdcP23738 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HdcP23738 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HdcP23738 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HdcP23738 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HdcP23738 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms