Protein–RNA interactions for Protein: P23708

Nfya, Nuclear transcription factor Y subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfyaP23708 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NfyaP23708 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NfyaP23708 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NfyaP23708 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NfyaP23708 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NfyaP23708 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NfyaP23708 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NfyaP23708 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NfyaP23708 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NfyaP23708 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NfyaP23708 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NfyaP23708 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NfyaP23708 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NfyaP23708 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NfyaP23708 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NfyaP23708 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NfyaP23708 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NfyaP23708 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NfyaP23708 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NfyaP23708 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NfyaP23708 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NfyaP23708 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NfyaP23708 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NfyaP23708 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NfyaP23708 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NfyaP23708 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NfyaP23708 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NfyaP23708 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NfyaP23708 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NfyaP23708 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NfyaP23708 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NfyaP23708 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NfyaP23708 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NfyaP23708 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NfyaP23708 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NfyaP23708 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NfyaP23708 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NfyaP23708 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NfyaP23708 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NfyaP23708 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NfyaP23708 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NfyaP23708 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NfyaP23708 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NfyaP23708 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NfyaP23708 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NfyaP23708 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NfyaP23708 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NfyaP23708 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NfyaP23708 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NfyaP23708 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NfyaP23708 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NfyaP23708 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NfyaP23708 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NfyaP23708 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NfyaP23708 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NfyaP23708 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NfyaP23708 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NfyaP23708 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NfyaP23708 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NfyaP23708 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NfyaP23708 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NfyaP23708 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NfyaP23708 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NfyaP23708 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NfyaP23708 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NfyaP23708 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NfyaP23708 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NfyaP23708 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NfyaP23708 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NfyaP23708 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NfyaP23708 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NfyaP23708 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NfyaP23708 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NfyaP23708 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NfyaP23708 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NfyaP23708 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NfyaP23708 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NfyaP23708 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NfyaP23708 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NfyaP23708 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NfyaP23708 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NfyaP23708 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NfyaP23708 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NfyaP23708 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NfyaP23708 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NfyaP23708 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NfyaP23708 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NfyaP23708 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NfyaP23708 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NfyaP23708 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NfyaP23708 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NfyaP23708 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NfyaP23708 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NfyaP23708 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NfyaP23708 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NfyaP23708 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NfyaP23708 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NfyaP23708 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NfyaP23708 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NfyaP23708 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms