Protein–RNA interactions for Protein: P23708

Nfya, Nuclear transcription factor Y subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfyaP23708 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NfyaP23708 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NfyaP23708 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NfyaP23708 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NfyaP23708 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NfyaP23708 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NfyaP23708 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NfyaP23708 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NfyaP23708 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NfyaP23708 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NfyaP23708 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NfyaP23708 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NfyaP23708 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NfyaP23708 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NfyaP23708 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NfyaP23708 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NfyaP23708 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NfyaP23708 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NfyaP23708 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NfyaP23708 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NfyaP23708 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NfyaP23708 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NfyaP23708 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NfyaP23708 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NfyaP23708 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NfyaP23708 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NfyaP23708 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NfyaP23708 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NfyaP23708 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NfyaP23708 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NfyaP23708 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NfyaP23708 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NfyaP23708 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NfyaP23708 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NfyaP23708 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NfyaP23708 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NfyaP23708 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NfyaP23708 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NfyaP23708 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NfyaP23708 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NfyaP23708 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NfyaP23708 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NfyaP23708 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NfyaP23708 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NfyaP23708 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NfyaP23708 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NfyaP23708 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NfyaP23708 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NfyaP23708 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NfyaP23708 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NfyaP23708 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NfyaP23708 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NfyaP23708 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NfyaP23708 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NfyaP23708 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NfyaP23708 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NfyaP23708 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NfyaP23708 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NfyaP23708 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NfyaP23708 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NfyaP23708 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NfyaP23708 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NfyaP23708 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NfyaP23708 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NfyaP23708 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NfyaP23708 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NfyaP23708 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NfyaP23708 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NfyaP23708 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NfyaP23708 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NfyaP23708 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NfyaP23708 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NfyaP23708 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NfyaP23708 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NfyaP23708 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NfyaP23708 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NfyaP23708 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NfyaP23708 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NfyaP23708 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NfyaP23708 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NfyaP23708 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NfyaP23708 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NfyaP23708 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NfyaP23708 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NfyaP23708 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NfyaP23708 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NfyaP23708 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NfyaP23708 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NfyaP23708 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NfyaP23708 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NfyaP23708 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NfyaP23708 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NfyaP23708 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
NfyaP23708 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NfyaP23708 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NfyaP23708 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NfyaP23708 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NfyaP23708 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NfyaP23708 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NfyaP23708 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms