Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Eif3aP23116 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Eif3aP23116 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Eif3aP23116 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Eif3aP23116 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Eif3aP23116 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Eif3aP23116 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Eif3aP23116 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Eif3aP23116 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Eif3aP23116 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Eif3aP23116 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Eif3aP23116 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Eif3aP23116 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Eif3aP23116 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Eif3aP23116 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Eif3aP23116 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Eif3aP23116 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Eif3aP23116 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Eif3aP23116 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Eif3aP23116 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Eif3aP23116 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Eif3aP23116 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Eif3aP23116 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Eif3aP23116 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Eif3aP23116 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Eif3aP23116 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Eif3aP23116 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Eif3aP23116 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Eif3aP23116 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Eif3aP23116 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Eif3aP23116 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Eif3aP23116 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Eif3aP23116 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Eif3aP23116 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Eif3aP23116 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Eif3aP23116 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Eif3aP23116 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Eif3aP23116 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Eif3aP23116 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Eif3aP23116 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Eif3aP23116 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Eif3aP23116 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Eif3aP23116 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Eif3aP23116 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Eif3aP23116 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Eif3aP23116 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Eif3aP23116 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Eif3aP23116 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Eif3aP23116 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Eif3aP23116 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Eif3aP23116 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Eif3aP23116 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Eif3aP23116 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Eif3aP23116 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Eif3aP23116 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Eif3aP23116 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Eif3aP23116 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Eif3aP23116 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Eif3aP23116 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Eif3aP23116 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Eif3aP23116 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Eif3aP23116 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Eif3aP23116 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Eif3aP23116 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Eif3aP23116 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Eif3aP23116 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Eif3aP23116 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Eif3aP23116 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Eif3aP23116 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Eif3aP23116 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Eif3aP23116 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Eif3aP23116 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Eif3aP23116 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Eif3aP23116 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Eif3aP23116 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Eif3aP23116 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Eif3aP23116 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Eif3aP23116 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Eif3aP23116 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Eif3aP23116 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Eif3aP23116 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Eif3aP23116 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Eif3aP23116 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Eif3aP23116 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Eif3aP23116 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Eif3aP23116 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Eif3aP23116 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Eif3aP23116 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Eif3aP23116 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Eif3aP23116 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Eif3aP23116 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Eif3aP23116 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Eif3aP23116 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Eif3aP23116 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Eif3aP23116 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Eif3aP23116 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Eif3aP23116 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Eif3aP23116 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Eif3aP23116 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Eif3aP23116 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms