Protein–RNA interactions for Protein: P21440

Abcb4, Phosphatidylcholine translocator ABCB4, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb4P21440 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Abcb4P21440 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Abcb4P21440 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Abcb4P21440 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Abcb4P21440 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Abcb4P21440 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Abcb4P21440 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Abcb4P21440 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Abcb4P21440 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Abcb4P21440 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Abcb4P21440 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Abcb4P21440 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Abcb4P21440 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Abcb4P21440 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Abcb4P21440 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Abcb4P21440 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Abcb4P21440 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Abcb4P21440 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Abcb4P21440 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Abcb4P21440 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Abcb4P21440 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Abcb4P21440 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Abcb4P21440 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Abcb4P21440 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Abcb4P21440 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Abcb4P21440 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Abcb4P21440 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Abcb4P21440 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Abcb4P21440 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Abcb4P21440 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Abcb4P21440 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Abcb4P21440 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Abcb4P21440 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Abcb4P21440 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Abcb4P21440 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Abcb4P21440 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Abcb4P21440 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Abcb4P21440 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Abcb4P21440 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Abcb4P21440 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Abcb4P21440 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Abcb4P21440 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Abcb4P21440 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Abcb4P21440 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Abcb4P21440 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Abcb4P21440 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Abcb4P21440 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Abcb4P21440 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Abcb4P21440 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Abcb4P21440 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Abcb4P21440 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Abcb4P21440 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Abcb4P21440 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Abcb4P21440 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Abcb4P21440 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Abcb4P21440 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Abcb4P21440 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Abcb4P21440 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Abcb4P21440 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Abcb4P21440 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Abcb4P21440 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Abcb4P21440 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Abcb4P21440 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Abcb4P21440 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Abcb4P21440 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Abcb4P21440 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Abcb4P21440 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Abcb4P21440 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Abcb4P21440 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Abcb4P21440 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Abcb4P21440 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Abcb4P21440 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Abcb4P21440 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Abcb4P21440 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Abcb4P21440 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Abcb4P21440 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Abcb4P21440 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Abcb4P21440 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Abcb4P21440 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Abcb4P21440 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Abcb4P21440 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Abcb4P21440 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Abcb4P21440 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Abcb4P21440 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Abcb4P21440 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Abcb4P21440 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Abcb4P21440 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Abcb4P21440 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Abcb4P21440 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Abcb4P21440 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Abcb4P21440 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Abcb4P21440 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Abcb4P21440 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Abcb4P21440 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Abcb4P21440 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Abcb4P21440 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Abcb4P21440 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Abcb4P21440 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Abcb4P21440 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Abcb4P21440 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms