Protein–RNA interactions for Protein: P21237

Bdnf, Brain-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BdnfP21237 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BdnfP21237 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BdnfP21237 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BdnfP21237 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
BdnfP21237 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BdnfP21237 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BdnfP21237 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
BdnfP21237 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BdnfP21237 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BdnfP21237 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BdnfP21237 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BdnfP21237 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BdnfP21237 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BdnfP21237 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BdnfP21237 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BdnfP21237 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BdnfP21237 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BdnfP21237 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BdnfP21237 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BdnfP21237 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BdnfP21237 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BdnfP21237 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BdnfP21237 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BdnfP21237 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BdnfP21237 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BdnfP21237 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BdnfP21237 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BdnfP21237 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BdnfP21237 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BdnfP21237 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BdnfP21237 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BdnfP21237 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BdnfP21237 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BdnfP21237 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BdnfP21237 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BdnfP21237 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BdnfP21237 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BdnfP21237 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BdnfP21237 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BdnfP21237 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BdnfP21237 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BdnfP21237 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BdnfP21237 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BdnfP21237 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BdnfP21237 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BdnfP21237 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BdnfP21237 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BdnfP21237 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BdnfP21237 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BdnfP21237 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BdnfP21237 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BdnfP21237 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BdnfP21237 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BdnfP21237 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BdnfP21237 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BdnfP21237 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BdnfP21237 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
BdnfP21237 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BdnfP21237 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BdnfP21237 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BdnfP21237 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BdnfP21237 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BdnfP21237 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BdnfP21237 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BdnfP21237 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BdnfP21237 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BdnfP21237 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BdnfP21237 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BdnfP21237 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BdnfP21237 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BdnfP21237 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BdnfP21237 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BdnfP21237 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BdnfP21237 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BdnfP21237 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
BdnfP21237 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BdnfP21237 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BdnfP21237 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BdnfP21237 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BdnfP21237 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
BdnfP21237 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BdnfP21237 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BdnfP21237 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BdnfP21237 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BdnfP21237 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BdnfP21237 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BdnfP21237 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BdnfP21237 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BdnfP21237 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BdnfP21237 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BdnfP21237 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BdnfP21237 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BdnfP21237 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BdnfP21237 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BdnfP21237 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BdnfP21237 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BdnfP21237 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BdnfP21237 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BdnfP21237 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BdnfP21237 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.7 ms