Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ntf3P20181 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ntf3P20181 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ntf3P20181 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ntf3P20181 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ntf3P20181 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ntf3P20181 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ntf3P20181 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ntf3P20181 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ntf3P20181 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ntf3P20181 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ntf3P20181 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ntf3P20181 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ntf3P20181 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ntf3P20181 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ntf3P20181 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ntf3P20181 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ntf3P20181 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ntf3P20181 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ntf3P20181 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ntf3P20181 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ntf3P20181 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ntf3P20181 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ntf3P20181 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ntf3P20181 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ntf3P20181 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ntf3P20181 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ntf3P20181 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ntf3P20181 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Ntf3P20181 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Ntf3P20181 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ntf3P20181 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ntf3P20181 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ntf3P20181 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ntf3P20181 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ntf3P20181 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ntf3P20181 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ntf3P20181 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ntf3P20181 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ntf3P20181 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ntf3P20181 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ntf3P20181 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ntf3P20181 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ntf3P20181 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ntf3P20181 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ntf3P20181 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ntf3P20181 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ntf3P20181 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ntf3P20181 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ntf3P20181 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ntf3P20181 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ntf3P20181 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ntf3P20181 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ntf3P20181 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ntf3P20181 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ntf3P20181 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ntf3P20181 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Ntf3P20181 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ntf3P20181 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ntf3P20181 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Ntf3P20181 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ntf3P20181 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ntf3P20181 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ntf3P20181 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ntf3P20181 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ntf3P20181 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ntf3P20181 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ntf3P20181 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ntf3P20181 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ntf3P20181 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ntf3P20181 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ntf3P20181 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ntf3P20181 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ntf3P20181 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ntf3P20181 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ntf3P20181 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ntf3P20181 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ntf3P20181 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ntf3P20181 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ntf3P20181 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ntf3P20181 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ntf3P20181 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ntf3P20181 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ntf3P20181 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ntf3P20181 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ntf3P20181 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ntf3P20181 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ntf3P20181 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ntf3P20181 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ntf3P20181 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ntf3P20181 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ntf3P20181 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ntf3P20181 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ntf3P20181 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ntf3P20181 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Ntf3P20181 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ntf3P20181 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ntf3P20181 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ntf3P20181 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ntf3P20181 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms