Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VimP20152 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VimP20152 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VimP20152 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VimP20152 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
VimP20152 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VimP20152 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VimP20152 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VimP20152 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VimP20152 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VimP20152 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VimP20152 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VimP20152 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VimP20152 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VimP20152 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VimP20152 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VimP20152 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VimP20152 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VimP20152 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VimP20152 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VimP20152 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VimP20152 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VimP20152 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VimP20152 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VimP20152 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VimP20152 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VimP20152 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VimP20152 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VimP20152 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VimP20152 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VimP20152 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
VimP20152 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VimP20152 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VimP20152 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VimP20152 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
VimP20152 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VimP20152 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VimP20152 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VimP20152 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VimP20152 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VimP20152 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VimP20152 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VimP20152 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VimP20152 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VimP20152 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VimP20152 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
VimP20152 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VimP20152 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VimP20152 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VimP20152 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VimP20152 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VimP20152 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VimP20152 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VimP20152 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VimP20152 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VimP20152 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VimP20152 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VimP20152 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VimP20152 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VimP20152 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VimP20152 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VimP20152 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VimP20152 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VimP20152 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VimP20152 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VimP20152 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VimP20152 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VimP20152 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VimP20152 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VimP20152 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VimP20152 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VimP20152 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VimP20152 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VimP20152 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VimP20152 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VimP20152 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VimP20152 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VimP20152 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
VimP20152 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VimP20152 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VimP20152 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VimP20152 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VimP20152 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VimP20152 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VimP20152 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VimP20152 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VimP20152 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VimP20152 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VimP20152 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VimP20152 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VimP20152 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VimP20152 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VimP20152 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VimP20152 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VimP20152 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VimP20152 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VimP20152 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VimP20152 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VimP20152 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VimP20152 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms