Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ms4a1P19437 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ms4a1P19437 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ms4a1P19437 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ms4a1P19437 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ms4a1P19437 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ms4a1P19437 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ms4a1P19437 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ms4a1P19437 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ms4a1P19437 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ms4a1P19437 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ms4a1P19437 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ms4a1P19437 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ms4a1P19437 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ms4a1P19437 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ms4a1P19437 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ms4a1P19437 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ms4a1P19437 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ms4a1P19437 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ms4a1P19437 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ms4a1P19437 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ms4a1P19437 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ms4a1P19437 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ms4a1P19437 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ms4a1P19437 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ms4a1P19437 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ms4a1P19437 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ms4a1P19437 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ms4a1P19437 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ms4a1P19437 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ms4a1P19437 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ms4a1P19437 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ms4a1P19437 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ms4a1P19437 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ms4a1P19437 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ms4a1P19437 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ms4a1P19437 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ms4a1P19437 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ms4a1P19437 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ms4a1P19437 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ms4a1P19437 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ms4a1P19437 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ms4a1P19437 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ms4a1P19437 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ms4a1P19437 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ms4a1P19437 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ms4a1P19437 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ms4a1P19437 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ms4a1P19437 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ms4a1P19437 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ms4a1P19437 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ms4a1P19437 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ms4a1P19437 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ms4a1P19437 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ms4a1P19437 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ms4a1P19437 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ms4a1P19437 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ms4a1P19437 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ms4a1P19437 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ms4a1P19437 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ms4a1P19437 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ms4a1P19437 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ms4a1P19437 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ms4a1P19437 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ms4a1P19437 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ms4a1P19437 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ms4a1P19437 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ms4a1P19437 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ms4a1P19437 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ms4a1P19437 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ms4a1P19437 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ms4a1P19437 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ms4a1P19437 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ms4a1P19437 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ms4a1P19437 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ms4a1P19437 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ms4a1P19437 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ms4a1P19437 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ms4a1P19437 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ms4a1P19437 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ms4a1P19437 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ms4a1P19437 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ms4a1P19437 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ms4a1P19437 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ms4a1P19437 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ms4a1P19437 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ms4a1P19437 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ms4a1P19437 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ms4a1P19437 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ms4a1P19437 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ms4a1P19437 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ms4a1P19437 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ms4a1P19437 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ms4a1P19437 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ms4a1P19437 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ms4a1P19437 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ms4a1P19437 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ms4a1P19437 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ms4a1P19437 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ms4a1P19437 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms