Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rps6ka1P18653 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rps6ka1P18653 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rps6ka1P18653 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rps6ka1P18653 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rps6ka1P18653 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rps6ka1P18653 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rps6ka1P18653 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rps6ka1P18653 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rps6ka1P18653 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rps6ka1P18653 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rps6ka1P18653 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rps6ka1P18653 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rps6ka1P18653 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rps6ka1P18653 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rps6ka1P18653 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rps6ka1P18653 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rps6ka1P18653 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rps6ka1P18653 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rps6ka1P18653 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rps6ka1P18653 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rps6ka1P18653 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rps6ka1P18653 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rps6ka1P18653 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rps6ka1P18653 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rps6ka1P18653 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rps6ka1P18653 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rps6ka1P18653 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rps6ka1P18653 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Rps6ka1P18653 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rps6ka1P18653 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rps6ka1P18653 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rps6ka1P18653 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rps6ka1P18653 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rps6ka1P18653 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rps6ka1P18653 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rps6ka1P18653 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rps6ka1P18653 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rps6ka1P18653 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rps6ka1P18653 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rps6ka1P18653 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rps6ka1P18653 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rps6ka1P18653 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rps6ka1P18653 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rps6ka1P18653 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rps6ka1P18653 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rps6ka1P18653 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rps6ka1P18653 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rps6ka1P18653 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rps6ka1P18653 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rps6ka1P18653 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rps6ka1P18653 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rps6ka1P18653 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rps6ka1P18653 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rps6ka1P18653 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rps6ka1P18653 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rps6ka1P18653 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rps6ka1P18653 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rps6ka1P18653 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rps6ka1P18653 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rps6ka1P18653 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rps6ka1P18653 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rps6ka1P18653 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rps6ka1P18653 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rps6ka1P18653 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rps6ka1P18653 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rps6ka1P18653 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rps6ka1P18653 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rps6ka1P18653 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rps6ka1P18653 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rps6ka1P18653 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rps6ka1P18653 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rps6ka1P18653 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rps6ka1P18653 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rps6ka1P18653 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rps6ka1P18653 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rps6ka1P18653 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rps6ka1P18653 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rps6ka1P18653 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rps6ka1P18653 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rps6ka1P18653 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rps6ka1P18653 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rps6ka1P18653 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rps6ka1P18653 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rps6ka1P18653 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rps6ka1P18653 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rps6ka1P18653 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rps6ka1P18653 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rps6ka1P18653 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rps6ka1P18653 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rps6ka1P18653 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rps6ka1P18653 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rps6ka1P18653 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rps6ka1P18653 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rps6ka1P18653 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rps6ka1P18653 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rps6ka1P18653 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rps6ka1P18653 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rps6ka1P18653 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rps6ka1P18653 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.5 ms