Protein–RNA interactions for Protein: P17534

Defa-rs2, Alpha-defensin-related sequence 2, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs2P17534 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Defa-rs2P17534 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Defa-rs2P17534 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Defa-rs2P17534 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Defa-rs2P17534 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Defa-rs2P17534 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Defa-rs2P17534 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Defa-rs2P17534 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Defa-rs2P17534 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Defa-rs2P17534 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Defa-rs2P17534 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Defa-rs2P17534 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Defa-rs2P17534 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Defa-rs2P17534 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Defa-rs2P17534 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Defa-rs2P17534 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Defa-rs2P17534 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Defa-rs2P17534 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Defa-rs2P17534 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Defa-rs2P17534 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Defa-rs2P17534 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Defa-rs2P17534 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Defa-rs2P17534 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Defa-rs2P17534 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Defa-rs2P17534 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Defa-rs2P17534 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Defa-rs2P17534 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Defa-rs2P17534 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Defa-rs2P17534 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Defa-rs2P17534 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Defa-rs2P17534 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Defa-rs2P17534 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Defa-rs2P17534 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Defa-rs2P17534 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Defa-rs2P17534 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Defa-rs2P17534 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Defa-rs2P17534 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Defa-rs2P17534 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Defa-rs2P17534 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Defa-rs2P17534 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Defa-rs2P17534 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Defa-rs2P17534 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Defa-rs2P17534 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Defa-rs2P17534 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Defa-rs2P17534 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Defa-rs2P17534 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Defa-rs2P17534 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Defa-rs2P17534 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Defa-rs2P17534 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Defa-rs2P17534 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Defa-rs2P17534 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Defa-rs2P17534 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Defa-rs2P17534 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Defa-rs2P17534 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Defa-rs2P17534 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Defa-rs2P17534 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Defa-rs2P17534 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Defa-rs2P17534 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Defa-rs2P17534 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Defa-rs2P17534 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Defa-rs2P17534 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Defa-rs2P17534 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Defa-rs2P17534 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Defa-rs2P17534 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Defa-rs2P17534 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Defa-rs2P17534 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Defa-rs2P17534 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Defa-rs2P17534 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Defa-rs2P17534 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Defa-rs2P17534 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Defa-rs2P17534 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Defa-rs2P17534 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Defa-rs2P17534 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Defa-rs2P17534 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Defa-rs2P17534 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Defa-rs2P17534 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Defa-rs2P17534 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Defa-rs2P17534 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Defa-rs2P17534 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Defa-rs2P17534 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Defa-rs2P17534 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Defa-rs2P17534 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Defa-rs2P17534 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Defa-rs2P17534 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Defa-rs2P17534 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Defa-rs2P17534 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Defa-rs2P17534 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Defa-rs2P17534 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Defa-rs2P17534 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Defa-rs2P17534 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Defa-rs2P17534 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Defa-rs2P17534 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Defa-rs2P17534 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Defa-rs2P17534 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Defa-rs2P17534 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Defa-rs2P17534 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Defa-rs2P17534 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Defa-rs2P17534 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Defa-rs2P17534 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Defa-rs2P17534 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms