Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rag1P15919 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rag1P15919 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rag1P15919 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rag1P15919 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rag1P15919 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rag1P15919 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rag1P15919 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rag1P15919 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rag1P15919 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Rag1P15919 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rag1P15919 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rag1P15919 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rag1P15919 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rag1P15919 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rag1P15919 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rag1P15919 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rag1P15919 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Rag1P15919 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rag1P15919 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rag1P15919 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rag1P15919 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rag1P15919 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rag1P15919 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rag1P15919 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rag1P15919 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rag1P15919 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rag1P15919 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Rag1P15919 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Rag1P15919 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rag1P15919 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rag1P15919 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rag1P15919 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rag1P15919 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rag1P15919 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Rag1P15919 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rag1P15919 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rag1P15919 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rag1P15919 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rag1P15919 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rag1P15919 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rag1P15919 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rag1P15919 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rag1P15919 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rag1P15919 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rag1P15919 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rag1P15919 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rag1P15919 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rag1P15919 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rag1P15919 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rag1P15919 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rag1P15919 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rag1P15919 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rag1P15919 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rag1P15919 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rag1P15919 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rag1P15919 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rag1P15919 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rag1P15919 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rag1P15919 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rag1P15919 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rag1P15919 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rag1P15919 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rag1P15919 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rag1P15919 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rag1P15919 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rag1P15919 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rag1P15919 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rag1P15919 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rag1P15919 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rag1P15919 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rag1P15919 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rag1P15919 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rag1P15919 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rag1P15919 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rag1P15919 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rag1P15919 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rag1P15919 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rag1P15919 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rag1P15919 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rag1P15919 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rag1P15919 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rag1P15919 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rag1P15919 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Rag1P15919 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rag1P15919 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rag1P15919 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rag1P15919 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rag1P15919 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rag1P15919 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rag1P15919 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rag1P15919 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rag1P15919 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rag1P15919 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rag1P15919 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rag1P15919 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rag1P15919 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rag1P15919 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rag1P15919 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rag1P15919 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 400.9 ms