Protein–RNA interactions for Protein: P13541

Myh3, Myosin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,940 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh3P13541 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Myh3P13541 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Myh3P13541 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Myh3P13541 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Myh3P13541 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Myh3P13541 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Myh3P13541 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Myh3P13541 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Myh3P13541 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Myh3P13541 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Myh3P13541 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Myh3P13541 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Myh3P13541 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Myh3P13541 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Myh3P13541 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Myh3P13541 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Myh3P13541 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Myh3P13541 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Myh3P13541 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Myh3P13541 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Myh3P13541 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Myh3P13541 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Myh3P13541 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Myh3P13541 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Myh3P13541 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Myh3P13541 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Myh3P13541 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Myh3P13541 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Myh3P13541 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Myh3P13541 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Myh3P13541 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Myh3P13541 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Myh3P13541 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Myh3P13541 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Myh3P13541 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Myh3P13541 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Myh3P13541 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Myh3P13541 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Myh3P13541 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Myh3P13541 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Myh3P13541 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Myh3P13541 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Myh3P13541 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Myh3P13541 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Myh3P13541 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Myh3P13541 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Myh3P13541 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Myh3P13541 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Myh3P13541 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Myh3P13541 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Myh3P13541 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Myh3P13541 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Myh3P13541 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Myh3P13541 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Myh3P13541 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Myh3P13541 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Myh3P13541 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Myh3P13541 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Myh3P13541 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Myh3P13541 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Myh3P13541 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Myh3P13541 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Myh3P13541 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Myh3P13541 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Myh3P13541 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Myh3P13541 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Myh3P13541 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Myh3P13541 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Myh3P13541 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Myh3P13541 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Myh3P13541 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Myh3P13541 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Myh3P13541 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Myh3P13541 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Myh3P13541 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Myh3P13541 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Myh3P13541 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Myh3P13541 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Myh3P13541 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Myh3P13541 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Myh3P13541 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Myh3P13541 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Myh3P13541 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Myh3P13541 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Myh3P13541 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Myh3P13541 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Myh3P13541 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Myh3P13541 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Myh3P13541 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Myh3P13541 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Myh3P13541 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Myh3P13541 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Myh3P13541 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Myh3P13541 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Myh3P13541 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Myh3P13541 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Myh3P13541 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Myh3P13541 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Myh3P13541 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Myh3P13541 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms