Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Calb1P12658 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Calb1P12658 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Calb1P12658 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Calb1P12658 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Calb1P12658 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Calb1P12658 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Calb1P12658 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Calb1P12658 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Calb1P12658 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Calb1P12658 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Calb1P12658 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Calb1P12658 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Calb1P12658 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Calb1P12658 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Calb1P12658 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Calb1P12658 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Calb1P12658 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Calb1P12658 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Calb1P12658 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Calb1P12658 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Calb1P12658 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Calb1P12658 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Calb1P12658 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Calb1P12658 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Calb1P12658 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Calb1P12658 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Calb1P12658 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Calb1P12658 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Calb1P12658 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Calb1P12658 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Calb1P12658 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Calb1P12658 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Calb1P12658 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Calb1P12658 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Calb1P12658 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Calb1P12658 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Calb1P12658 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Calb1P12658 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Calb1P12658 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Calb1P12658 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Calb1P12658 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Calb1P12658 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Calb1P12658 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Calb1P12658 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Calb1P12658 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Calb1P12658 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Calb1P12658 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Calb1P12658 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Calb1P12658 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Calb1P12658 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Calb1P12658 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Calb1P12658 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Calb1P12658 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Calb1P12658 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Calb1P12658 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Calb1P12658 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Calb1P12658 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Calb1P12658 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Calb1P12658 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Calb1P12658 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Calb1P12658 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Calb1P12658 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Calb1P12658 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Calb1P12658 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Calb1P12658 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Calb1P12658 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Calb1P12658 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Calb1P12658 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Calb1P12658 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Calb1P12658 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Calb1P12658 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Calb1P12658 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Calb1P12658 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Calb1P12658 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Calb1P12658 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Calb1P12658 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Calb1P12658 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Calb1P12658 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Calb1P12658 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Calb1P12658 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Calb1P12658 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Calb1P12658 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Calb1P12658 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Calb1P12658 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Calb1P12658 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Calb1P12658 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Calb1P12658 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Calb1P12658 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Calb1P12658 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Calb1P12658 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Calb1P12658 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Calb1P12658 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Calb1P12658 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Calb1P12658 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Calb1P12658 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Calb1P12658 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Calb1P12658 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Calb1P12658 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Calb1P12658 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms