Protein–RNA interactions for Protein: P11688

Itga5, Integrin alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga5P11688 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itga5P11688 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itga5P11688 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itga5P11688 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itga5P11688 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itga5P11688 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itga5P11688 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itga5P11688 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Itga5P11688 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itga5P11688 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itga5P11688 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itga5P11688 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itga5P11688 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itga5P11688 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itga5P11688 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itga5P11688 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itga5P11688 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itga5P11688 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itga5P11688 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itga5P11688 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itga5P11688 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itga5P11688 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itga5P11688 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itga5P11688 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itga5P11688 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itga5P11688 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itga5P11688 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itga5P11688 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Itga5P11688 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itga5P11688 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itga5P11688 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itga5P11688 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itga5P11688 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itga5P11688 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itga5P11688 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itga5P11688 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itga5P11688 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itga5P11688 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itga5P11688 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Itga5P11688 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itga5P11688 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Itga5P11688 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itga5P11688 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itga5P11688 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itga5P11688 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itga5P11688 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itga5P11688 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itga5P11688 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itga5P11688 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itga5P11688 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itga5P11688 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itga5P11688 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itga5P11688 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itga5P11688 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itga5P11688 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itga5P11688 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itga5P11688 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Itga5P11688 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Itga5P11688 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Itga5P11688 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Itga5P11688 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itga5P11688 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itga5P11688 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Itga5P11688 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itga5P11688 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itga5P11688 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itga5P11688 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itga5P11688 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itga5P11688 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itga5P11688 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itga5P11688 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itga5P11688 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itga5P11688 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Itga5P11688 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itga5P11688 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itga5P11688 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itga5P11688 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itga5P11688 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itga5P11688 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itga5P11688 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itga5P11688 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itga5P11688 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itga5P11688 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itga5P11688 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itga5P11688 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga5P11688 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga5P11688 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga5P11688 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga5P11688 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga5P11688 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Itga5P11688 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Itga5P11688 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Itga5P11688 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Itga5P11688 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Itga5P11688 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Itga5P11688 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Itga5P11688 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Itga5P11688 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Itga5P11688 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itga5P11688 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms